Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP54Q7Z3B4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUP54Q7Z3B4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP54Q7Z3B4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP54Q7Z3B4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP54Q7Z3B4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP54Q7Z3B4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP54Q7Z3B4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP54Q7Z3B4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP54Q7Z3B4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP54Q7Z3B4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP54Q7Z3B4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP54Q7Z3B4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP54Q7Z3B4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP54Q7Z3B4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP54Q7Z3B4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP54Q7Z3B4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP54Q7Z3B4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP54Q7Z3B4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP54Q7Z3B4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP54Q7Z3B4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP54Q7Z3B4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP54Q7Z3B4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP54Q7Z3B4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP54Q7Z3B4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP54Q7Z3B4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP54Q7Z3B4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP54Q7Z3B4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP54Q7Z3B4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP54Q7Z3B4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP54Q7Z3B4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP54Q7Z3B4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP54Q7Z3B4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP54Q7Z3B4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP54Q7Z3B4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP54Q7Z3B4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP54Q7Z3B4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP54Q7Z3B4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP54Q7Z3B4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP54Q7Z3B4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP54Q7Z3B4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP54Q7Z3B4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP54Q7Z3B4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP54Q7Z3B4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP54Q7Z3B4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP54Q7Z3B4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP54Q7Z3B4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NUP54Q7Z3B4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP54Q7Z3B4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP54Q7Z3B4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP54Q7Z3B4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NUP54Q7Z3B4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP54Q7Z3B4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP54Q7Z3B4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NUP54Q7Z3B4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP54Q7Z3B4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP54Q7Z3B4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP54Q7Z3B4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP54Q7Z3B4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP54Q7Z3B4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP54Q7Z3B4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP54Q7Z3B4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP54Q7Z3B4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP54Q7Z3B4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP54Q7Z3B4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP54Q7Z3B4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP54Q7Z3B4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP54Q7Z3B4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP54Q7Z3B4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP54Q7Z3B4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NUP54Q7Z3B4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP54Q7Z3B4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP54Q7Z3B4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP54Q7Z3B4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP54Q7Z3B4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP54Q7Z3B4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP54Q7Z3B4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NUP54Q7Z3B4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP54Q7Z3B4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP54Q7Z3B4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NUP54Q7Z3B4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NUP54Q7Z3B4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP54Q7Z3B4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NUP54Q7Z3B4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP54Q7Z3B4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP54Q7Z3B4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NUP54Q7Z3B4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP54Q7Z3B4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP54Q7Z3B4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NUP54Q7Z3B4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP54Q7Z3B4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NUP54Q7Z3B4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP54Q7Z3B4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP54Q7Z3B4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NUP54Q7Z3B4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP54Q7Z3B4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NUP54Q7Z3B4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP54Q7Z3B4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP54Q7Z3B4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NUP54Q7Z3B4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms