Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJ21

SPSB3, SPRY domain-containing SOCS box protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPSB3Q6PJ21 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPSB3Q6PJ21 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SPSB3Q6PJ21 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SPSB3Q6PJ21 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPSB3Q6PJ21 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SPSB3Q6PJ21 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SPSB3Q6PJ21 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPSB3Q6PJ21 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPSB3Q6PJ21 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPSB3Q6PJ21 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPSB3Q6PJ21 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPSB3Q6PJ21 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SPSB3Q6PJ21 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPSB3Q6PJ21 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPSB3Q6PJ21 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPSB3Q6PJ21 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPSB3Q6PJ21 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPSB3Q6PJ21 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPSB3Q6PJ21 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPSB3Q6PJ21 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPSB3Q6PJ21 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPSB3Q6PJ21 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPSB3Q6PJ21 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SPSB3Q6PJ21 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPSB3Q6PJ21 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPSB3Q6PJ21 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPSB3Q6PJ21 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPSB3Q6PJ21 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPSB3Q6PJ21 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPSB3Q6PJ21 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPSB3Q6PJ21 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPSB3Q6PJ21 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPSB3Q6PJ21 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPSB3Q6PJ21 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPSB3Q6PJ21 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPSB3Q6PJ21 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPSB3Q6PJ21 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPSB3Q6PJ21 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPSB3Q6PJ21 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPSB3Q6PJ21 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPSB3Q6PJ21 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPSB3Q6PJ21 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPSB3Q6PJ21 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPSB3Q6PJ21 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPSB3Q6PJ21 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPSB3Q6PJ21 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPSB3Q6PJ21 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPSB3Q6PJ21 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPSB3Q6PJ21 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPSB3Q6PJ21 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPSB3Q6PJ21 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPSB3Q6PJ21 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPSB3Q6PJ21 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPSB3Q6PJ21 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPSB3Q6PJ21 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPSB3Q6PJ21 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPSB3Q6PJ21 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPSB3Q6PJ21 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPSB3Q6PJ21 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPSB3Q6PJ21 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPSB3Q6PJ21 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPSB3Q6PJ21 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPSB3Q6PJ21 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPSB3Q6PJ21 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPSB3Q6PJ21 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPSB3Q6PJ21 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPSB3Q6PJ21 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPSB3Q6PJ21 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPSB3Q6PJ21 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPSB3Q6PJ21 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPSB3Q6PJ21 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SPSB3Q6PJ21 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPSB3Q6PJ21 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPSB3Q6PJ21 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPSB3Q6PJ21 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPSB3Q6PJ21 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPSB3Q6PJ21 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SPSB3Q6PJ21 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPSB3Q6PJ21 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPSB3Q6PJ21 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPSB3Q6PJ21 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPSB3Q6PJ21 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPSB3Q6PJ21 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPSB3Q6PJ21 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPSB3Q6PJ21 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPSB3Q6PJ21 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPSB3Q6PJ21 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPSB3Q6PJ21 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPSB3Q6PJ21 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPSB3Q6PJ21 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPSB3Q6PJ21 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPSB3Q6PJ21 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPSB3Q6PJ21 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPSB3Q6PJ21 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPSB3Q6PJ21 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPSB3Q6PJ21 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPSB3Q6PJ21 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPSB3Q6PJ21 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPSB3Q6PJ21 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPSB3Q6PJ21 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms