Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4F2

FDX2, Ferredoxin-2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDX2Q6P4F2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FDX2Q6P4F2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FDX2Q6P4F2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FDX2Q6P4F2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FDX2Q6P4F2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FDX2Q6P4F2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FDX2Q6P4F2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FDX2Q6P4F2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FDX2Q6P4F2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FDX2Q6P4F2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FDX2Q6P4F2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FDX2Q6P4F2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FDX2Q6P4F2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FDX2Q6P4F2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FDX2Q6P4F2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FDX2Q6P4F2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FDX2Q6P4F2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FDX2Q6P4F2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FDX2Q6P4F2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FDX2Q6P4F2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FDX2Q6P4F2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FDX2Q6P4F2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FDX2Q6P4F2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FDX2Q6P4F2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FDX2Q6P4F2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FDX2Q6P4F2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FDX2Q6P4F2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FDX2Q6P4F2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FDX2Q6P4F2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FDX2Q6P4F2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FDX2Q6P4F2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FDX2Q6P4F2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FDX2Q6P4F2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FDX2Q6P4F2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FDX2Q6P4F2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FDX2Q6P4F2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FDX2Q6P4F2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FDX2Q6P4F2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FDX2Q6P4F2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FDX2Q6P4F2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FDX2Q6P4F2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FDX2Q6P4F2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FDX2Q6P4F2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FDX2Q6P4F2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FDX2Q6P4F2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FDX2Q6P4F2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FDX2Q6P4F2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FDX2Q6P4F2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FDX2Q6P4F2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FDX2Q6P4F2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FDX2Q6P4F2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FDX2Q6P4F2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FDX2Q6P4F2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FDX2Q6P4F2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FDX2Q6P4F2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FDX2Q6P4F2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FDX2Q6P4F2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FDX2Q6P4F2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FDX2Q6P4F2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FDX2Q6P4F2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FDX2Q6P4F2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FDX2Q6P4F2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FDX2Q6P4F2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FDX2Q6P4F2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FDX2Q6P4F2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FDX2Q6P4F2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FDX2Q6P4F2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FDX2Q6P4F2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FDX2Q6P4F2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FDX2Q6P4F2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FDX2Q6P4F2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FDX2Q6P4F2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FDX2Q6P4F2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FDX2Q6P4F2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FDX2Q6P4F2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FDX2Q6P4F2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FDX2Q6P4F2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FDX2Q6P4F2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FDX2Q6P4F2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FDX2Q6P4F2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FDX2Q6P4F2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FDX2Q6P4F2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FDX2Q6P4F2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FDX2Q6P4F2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FDX2Q6P4F2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FDX2Q6P4F2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FDX2Q6P4F2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FDX2Q6P4F2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FDX2Q6P4F2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FDX2Q6P4F2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FDX2Q6P4F2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FDX2Q6P4F2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FDX2Q6P4F2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FDX2Q6P4F2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FDX2Q6P4F2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FDX2Q6P4F2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FDX2Q6P4F2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FDX2Q6P4F2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FDX2Q6P4F2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FDX2Q6P4F2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms