Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZZ7

CAPN13, Calpain-13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN13Q6MZZ7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAPN13Q6MZZ7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPN13Q6MZZ7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CAPN13Q6MZZ7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAPN13Q6MZZ7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CAPN13Q6MZZ7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CAPN13Q6MZZ7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CAPN13Q6MZZ7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAPN13Q6MZZ7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAPN13Q6MZZ7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CAPN13Q6MZZ7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAPN13Q6MZZ7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CAPN13Q6MZZ7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAPN13Q6MZZ7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAPN13Q6MZZ7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPN13Q6MZZ7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CAPN13Q6MZZ7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAPN13Q6MZZ7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAPN13Q6MZZ7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAPN13Q6MZZ7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPN13Q6MZZ7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CAPN13Q6MZZ7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPN13Q6MZZ7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CAPN13Q6MZZ7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPN13Q6MZZ7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPN13Q6MZZ7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPN13Q6MZZ7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CAPN13Q6MZZ7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPN13Q6MZZ7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPN13Q6MZZ7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAPN13Q6MZZ7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAPN13Q6MZZ7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPN13Q6MZZ7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPN13Q6MZZ7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPN13Q6MZZ7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPN13Q6MZZ7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPN13Q6MZZ7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPN13Q6MZZ7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPN13Q6MZZ7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPN13Q6MZZ7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPN13Q6MZZ7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPN13Q6MZZ7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAPN13Q6MZZ7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CAPN13Q6MZZ7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN13Q6MZZ7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CAPN13Q6MZZ7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPN13Q6MZZ7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CAPN13Q6MZZ7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CAPN13Q6MZZ7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPN13Q6MZZ7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPN13Q6MZZ7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPN13Q6MZZ7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPN13Q6MZZ7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPN13Q6MZZ7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPN13Q6MZZ7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPN13Q6MZZ7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPN13Q6MZZ7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPN13Q6MZZ7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CAPN13Q6MZZ7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPN13Q6MZZ7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CAPN13Q6MZZ7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPN13Q6MZZ7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPN13Q6MZZ7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CAPN13Q6MZZ7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPN13Q6MZZ7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPN13Q6MZZ7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CAPN13Q6MZZ7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPN13Q6MZZ7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPN13Q6MZZ7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPN13Q6MZZ7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CAPN13Q6MZZ7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPN13Q6MZZ7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPN13Q6MZZ7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPN13Q6MZZ7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPN13Q6MZZ7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAPN13Q6MZZ7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPN13Q6MZZ7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPN13Q6MZZ7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPN13Q6MZZ7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPN13Q6MZZ7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPN13Q6MZZ7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAPN13Q6MZZ7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
CAPN13Q6MZZ7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPN13Q6MZZ7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPN13Q6MZZ7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAPN13Q6MZZ7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAPN13Q6MZZ7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAPN13Q6MZZ7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPN13Q6MZZ7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPN13Q6MZZ7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAPN13Q6MZZ7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CAPN13Q6MZZ7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAPN13Q6MZZ7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAPN13Q6MZZ7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPN13Q6MZZ7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPN13Q6MZZ7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPN13Q6MZZ7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPN13Q6MZZ7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPN13Q6MZZ7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPN13Q6MZZ7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms