Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
L1TD1Q5T7N2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
L1TD1Q5T7N2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
L1TD1Q5T7N2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
L1TD1Q5T7N2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
L1TD1Q5T7N2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
L1TD1Q5T7N2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
L1TD1Q5T7N2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
L1TD1Q5T7N2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
L1TD1Q5T7N2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
L1TD1Q5T7N2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
L1TD1Q5T7N2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
L1TD1Q5T7N2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
L1TD1Q5T7N2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
L1TD1Q5T7N2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
L1TD1Q5T7N2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
L1TD1Q5T7N2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
L1TD1Q5T7N2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
L1TD1Q5T7N2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
L1TD1Q5T7N2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
L1TD1Q5T7N2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
L1TD1Q5T7N2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
L1TD1Q5T7N2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
L1TD1Q5T7N2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
L1TD1Q5T7N2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
L1TD1Q5T7N2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
L1TD1Q5T7N2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
L1TD1Q5T7N2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
L1TD1Q5T7N2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
L1TD1Q5T7N2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
L1TD1Q5T7N2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
L1TD1Q5T7N2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
L1TD1Q5T7N2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
L1TD1Q5T7N2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
L1TD1Q5T7N2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
L1TD1Q5T7N2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
L1TD1Q5T7N2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
L1TD1Q5T7N2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
L1TD1Q5T7N2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
L1TD1Q5T7N2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
L1TD1Q5T7N2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
L1TD1Q5T7N2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
L1TD1Q5T7N2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
L1TD1Q5T7N2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
L1TD1Q5T7N2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
L1TD1Q5T7N2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
L1TD1Q5T7N2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
L1TD1Q5T7N2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
L1TD1Q5T7N2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
L1TD1Q5T7N2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
L1TD1Q5T7N2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
L1TD1Q5T7N2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
L1TD1Q5T7N2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
L1TD1Q5T7N2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
L1TD1Q5T7N2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
L1TD1Q5T7N2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
L1TD1Q5T7N2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
L1TD1Q5T7N2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
L1TD1Q5T7N2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
L1TD1Q5T7N2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
L1TD1Q5T7N2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
L1TD1Q5T7N2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
L1TD1Q5T7N2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
L1TD1Q5T7N2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
L1TD1Q5T7N2 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
L1TD1Q5T7N2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
L1TD1Q5T7N2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
L1TD1Q5T7N2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
L1TD1Q5T7N2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
L1TD1Q5T7N2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
L1TD1Q5T7N2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
L1TD1Q5T7N2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
L1TD1Q5T7N2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
L1TD1Q5T7N2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
L1TD1Q5T7N2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
L1TD1Q5T7N2 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
L1TD1Q5T7N2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
L1TD1Q5T7N2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
L1TD1Q5T7N2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
L1TD1Q5T7N2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
L1TD1Q5T7N2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
L1TD1Q5T7N2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
L1TD1Q5T7N2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
L1TD1Q5T7N2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
L1TD1Q5T7N2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
L1TD1Q5T7N2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
L1TD1Q5T7N2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
L1TD1Q5T7N2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
L1TD1Q5T7N2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
L1TD1Q5T7N2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
L1TD1Q5T7N2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
L1TD1Q5T7N2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
L1TD1Q5T7N2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
L1TD1Q5T7N2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
L1TD1Q5T7N2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
L1TD1Q5T7N2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
L1TD1Q5T7N2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
L1TD1Q5T7N2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
L1TD1Q5T7N2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
L1TD1Q5T7N2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms