Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQF8

PABPC1L2A, Polyadenylate-binding protein 1-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1L2AQ5JQF8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PABPC1L2AQ5JQF8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PABPC1L2AQ5JQF8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PABPC1L2AQ5JQF8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PABPC1L2AQ5JQF8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PABPC1L2AQ5JQF8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PABPC1L2AQ5JQF8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PABPC1L2AQ5JQF8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PABPC1L2AQ5JQF8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PABPC1L2AQ5JQF8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PABPC1L2AQ5JQF8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PABPC1L2AQ5JQF8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PABPC1L2AQ5JQF8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PABPC1L2AQ5JQF8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PABPC1L2AQ5JQF8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PABPC1L2AQ5JQF8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PABPC1L2AQ5JQF8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PABPC1L2AQ5JQF8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC1L2AQ5JQF8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC1L2AQ5JQF8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC1L2AQ5JQF8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC1L2AQ5JQF8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PABPC1L2AQ5JQF8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PABPC1L2AQ5JQF8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PABPC1L2AQ5JQF8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PABPC1L2AQ5JQF8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PABPC1L2AQ5JQF8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PABPC1L2AQ5JQF8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PABPC1L2AQ5JQF8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PABPC1L2AQ5JQF8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PABPC1L2AQ5JQF8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PABPC1L2AQ5JQF8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PABPC1L2AQ5JQF8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PABPC1L2AQ5JQF8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PABPC1L2AQ5JQF8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PABPC1L2AQ5JQF8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PABPC1L2AQ5JQF8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PABPC1L2AQ5JQF8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PABPC1L2AQ5JQF8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PABPC1L2AQ5JQF8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PABPC1L2AQ5JQF8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PABPC1L2AQ5JQF8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PABPC1L2AQ5JQF8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PABPC1L2AQ5JQF8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PABPC1L2AQ5JQF8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PABPC1L2AQ5JQF8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PABPC1L2AQ5JQF8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PABPC1L2AQ5JQF8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PABPC1L2AQ5JQF8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PABPC1L2AQ5JQF8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PABPC1L2AQ5JQF8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PABPC1L2AQ5JQF8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PABPC1L2AQ5JQF8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PABPC1L2AQ5JQF8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PABPC1L2AQ5JQF8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PABPC1L2AQ5JQF8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PABPC1L2AQ5JQF8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PABPC1L2AQ5JQF8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PABPC1L2AQ5JQF8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PABPC1L2AQ5JQF8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PABPC1L2AQ5JQF8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PABPC1L2AQ5JQF8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PABPC1L2AQ5JQF8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PABPC1L2AQ5JQF8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PABPC1L2AQ5JQF8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PABPC1L2AQ5JQF8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PABPC1L2AQ5JQF8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PABPC1L2AQ5JQF8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PABPC1L2AQ5JQF8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PABPC1L2AQ5JQF8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PABPC1L2AQ5JQF8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PABPC1L2AQ5JQF8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PABPC1L2AQ5JQF8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PABPC1L2AQ5JQF8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PABPC1L2AQ5JQF8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PABPC1L2AQ5JQF8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PABPC1L2AQ5JQF8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PABPC1L2AQ5JQF8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
PABPC1L2AQ5JQF8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PABPC1L2AQ5JQF8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PABPC1L2AQ5JQF8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PABPC1L2AQ5JQF8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PABPC1L2AQ5JQF8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PABPC1L2AQ5JQF8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PABPC1L2AQ5JQF8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PABPC1L2AQ5JQF8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PABPC1L2AQ5JQF8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PABPC1L2AQ5JQF8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PABPC1L2AQ5JQF8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PABPC1L2AQ5JQF8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PABPC1L2AQ5JQF8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PABPC1L2AQ5JQF8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PABPC1L2AQ5JQF8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PABPC1L2AQ5JQF8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PABPC1L2AQ5JQF8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PABPC1L2AQ5JQF8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PABPC1L2AQ5JQF8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PABPC1L2AQ5JQF8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PABPC1L2AQ5JQF8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PABPC1L2AQ5JQF8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms