Protein–RNA interactions for Protein: Q16643

DBN1, Drebrin, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBN1Q16643 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DBN1Q16643 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DBN1Q16643 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DBN1Q16643 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DBN1Q16643 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DBN1Q16643 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DBN1Q16643 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DBN1Q16643 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DBN1Q16643 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DBN1Q16643 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DBN1Q16643 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DBN1Q16643 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DBN1Q16643 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DBN1Q16643 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
DBN1Q16643 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DBN1Q16643 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DBN1Q16643 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DBN1Q16643 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DBN1Q16643 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DBN1Q16643 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DBN1Q16643 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DBN1Q16643 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DBN1Q16643 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DBN1Q16643 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DBN1Q16643 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DBN1Q16643 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DBN1Q16643 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DBN1Q16643 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DBN1Q16643 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DBN1Q16643 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DBN1Q16643 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DBN1Q16643 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DBN1Q16643 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DBN1Q16643 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DBN1Q16643 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DBN1Q16643 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DBN1Q16643 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DBN1Q16643 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DBN1Q16643 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DBN1Q16643 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DBN1Q16643 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DBN1Q16643 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DBN1Q16643 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DBN1Q16643 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DBN1Q16643 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DBN1Q16643 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DBN1Q16643 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DBN1Q16643 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DBN1Q16643 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DBN1Q16643 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DBN1Q16643 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DBN1Q16643 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
DBN1Q16643 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DBN1Q16643 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DBN1Q16643 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DBN1Q16643 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DBN1Q16643 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DBN1Q16643 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DBN1Q16643 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DBN1Q16643 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DBN1Q16643 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DBN1Q16643 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DBN1Q16643 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
DBN1Q16643 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
DBN1Q16643 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DBN1Q16643 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DBN1Q16643 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DBN1Q16643 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DBN1Q16643 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DBN1Q16643 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DBN1Q16643 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DBN1Q16643 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DBN1Q16643 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DBN1Q16643 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DBN1Q16643 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
DBN1Q16643 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DBN1Q16643 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DBN1Q16643 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DBN1Q16643 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DBN1Q16643 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DBN1Q16643 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DBN1Q16643 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DBN1Q16643 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DBN1Q16643 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DBN1Q16643 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DBN1Q16643 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DBN1Q16643 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DBN1Q16643 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DBN1Q16643 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DBN1Q16643 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DBN1Q16643 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DBN1Q16643 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DBN1Q16643 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DBN1Q16643 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DBN1Q16643 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DBN1Q16643 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DBN1Q16643 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DBN1Q16643 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DBN1Q16643 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DBN1Q16643 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms