Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LY6EQ16553 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LY6EQ16553 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LY6EQ16553 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LY6EQ16553 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LY6EQ16553 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LY6EQ16553 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LY6EQ16553 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LY6EQ16553 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LY6EQ16553 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LY6EQ16553 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LY6EQ16553 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LY6EQ16553 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LY6EQ16553 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LY6EQ16553 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LY6EQ16553 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LY6EQ16553 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LY6EQ16553 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LY6EQ16553 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LY6EQ16553 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LY6EQ16553 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LY6EQ16553 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LY6EQ16553 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LY6EQ16553 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LY6EQ16553 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LY6EQ16553 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LY6EQ16553 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LY6EQ16553 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LY6EQ16553 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LY6EQ16553 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LY6EQ16553 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LY6EQ16553 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LY6EQ16553 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LY6EQ16553 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LY6EQ16553 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LY6EQ16553 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LY6EQ16553 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LY6EQ16553 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LY6EQ16553 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LY6EQ16553 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LY6EQ16553 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LY6EQ16553 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LY6EQ16553 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LY6EQ16553 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LY6EQ16553 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LY6EQ16553 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LY6EQ16553 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LY6EQ16553 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LY6EQ16553 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LY6EQ16553 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LY6EQ16553 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LY6EQ16553 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LY6EQ16553 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY6EQ16553 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY6EQ16553 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LY6EQ16553 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LY6EQ16553 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LY6EQ16553 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LY6EQ16553 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LY6EQ16553 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LY6EQ16553 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LY6EQ16553 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LY6EQ16553 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LY6EQ16553 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LY6EQ16553 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LY6EQ16553 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LY6EQ16553 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LY6EQ16553 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LY6EQ16553 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LY6EQ16553 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LY6EQ16553 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LY6EQ16553 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LY6EQ16553 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LY6EQ16553 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LY6EQ16553 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LY6EQ16553 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LY6EQ16553 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LY6EQ16553 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LY6EQ16553 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LY6EQ16553 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LY6EQ16553 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LY6EQ16553 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LY6EQ16553 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LY6EQ16553 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LY6EQ16553 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LY6EQ16553 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LY6EQ16553 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LY6EQ16553 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LY6EQ16553 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LY6EQ16553 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LY6EQ16553 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LY6EQ16553 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LY6EQ16553 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LY6EQ16553 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LY6EQ16553 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LY6EQ16553 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LY6EQ16553 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LY6EQ16553 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LY6EQ16553 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LY6EQ16553 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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