Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
LY6EQ16553 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LY6EQ16553 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LY6EQ16553 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LY6EQ16553 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LY6EQ16553 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LY6EQ16553 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LY6EQ16553 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LY6EQ16553 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LY6EQ16553 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LY6EQ16553 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LY6EQ16553 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LY6EQ16553 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LY6EQ16553 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LY6EQ16553 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LY6EQ16553 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LY6EQ16553 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LY6EQ16553 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LY6EQ16553 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LY6EQ16553 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LY6EQ16553 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LY6EQ16553 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LY6EQ16553 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LY6EQ16553 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LY6EQ16553 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LY6EQ16553 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LY6EQ16553 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LY6EQ16553 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LY6EQ16553 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LY6EQ16553 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LY6EQ16553 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LY6EQ16553 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LY6EQ16553 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LY6EQ16553 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LY6EQ16553 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LY6EQ16553 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LY6EQ16553 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LY6EQ16553 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LY6EQ16553 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LY6EQ16553 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LY6EQ16553 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LY6EQ16553 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LY6EQ16553 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LY6EQ16553 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LY6EQ16553 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LY6EQ16553 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LY6EQ16553 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LY6EQ16553 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LY6EQ16553 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LY6EQ16553 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LY6EQ16553 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LY6EQ16553 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LY6EQ16553 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LY6EQ16553 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LY6EQ16553 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LY6EQ16553 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LY6EQ16553 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LY6EQ16553 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LY6EQ16553 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LY6EQ16553 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LY6EQ16553 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LY6EQ16553 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LY6EQ16553 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LY6EQ16553 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LY6EQ16553 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LY6EQ16553 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LY6EQ16553 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LY6EQ16553 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LY6EQ16553 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LY6EQ16553 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LY6EQ16553 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LY6EQ16553 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LY6EQ16553 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LY6EQ16553 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LY6EQ16553 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LY6EQ16553 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LY6EQ16553 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LY6EQ16553 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LY6EQ16553 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LY6EQ16553 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LY6EQ16553 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LY6EQ16553 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LY6EQ16553 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LY6EQ16553 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LY6EQ16553 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LY6EQ16553 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LY6EQ16553 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LY6EQ16553 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LY6EQ16553 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LY6EQ16553 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LY6EQ16553 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LY6EQ16553 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LY6EQ16553 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LY6EQ16553 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LY6EQ16553 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LY6EQ16553 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LY6EQ16553 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LY6EQ16553 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LY6EQ16553 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LY6EQ16553 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
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