Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
COL9A3Q14050 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
COL9A3Q14050 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
COL9A3Q14050 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
COL9A3Q14050 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
COL9A3Q14050 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
COL9A3Q14050 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
COL9A3Q14050 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
COL9A3Q14050 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
COL9A3Q14050 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
COL9A3Q14050 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
COL9A3Q14050 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
COL9A3Q14050 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
COL9A3Q14050 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
COL9A3Q14050 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
COL9A3Q14050 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
COL9A3Q14050 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
COL9A3Q14050 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
COL9A3Q14050 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
COL9A3Q14050 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
COL9A3Q14050 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
COL9A3Q14050 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
COL9A3Q14050 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
COL9A3Q14050 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
COL9A3Q14050 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
COL9A3Q14050 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
COL9A3Q14050 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
COL9A3Q14050 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
COL9A3Q14050 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
COL9A3Q14050 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
COL9A3Q14050 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
COL9A3Q14050 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
COL9A3Q14050 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
COL9A3Q14050 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
COL9A3Q14050 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
COL9A3Q14050 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
COL9A3Q14050 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
COL9A3Q14050 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
COL9A3Q14050 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
COL9A3Q14050 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
COL9A3Q14050 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
COL9A3Q14050 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
COL9A3Q14050 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
COL9A3Q14050 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
COL9A3Q14050 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
COL9A3Q14050 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
COL9A3Q14050 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
COL9A3Q14050 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
COL9A3Q14050 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
COL9A3Q14050 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
COL9A3Q14050 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
COL9A3Q14050 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
COL9A3Q14050 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
COL9A3Q14050 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
COL9A3Q14050 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
COL9A3Q14050 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
COL9A3Q14050 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
COL9A3Q14050 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
COL9A3Q14050 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
COL9A3Q14050 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
COL9A3Q14050 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
COL9A3Q14050 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
COL9A3Q14050 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
COL9A3Q14050 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
COL9A3Q14050 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
COL9A3Q14050 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
COL9A3Q14050 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
COL9A3Q14050 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
COL9A3Q14050 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
COL9A3Q14050 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
COL9A3Q14050 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
COL9A3Q14050 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
COL9A3Q14050 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
COL9A3Q14050 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
COL9A3Q14050 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
COL9A3Q14050 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
COL9A3Q14050 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
COL9A3Q14050 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
COL9A3Q14050 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
COL9A3Q14050 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
COL9A3Q14050 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
COL9A3Q14050 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
COL9A3Q14050 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
COL9A3Q14050 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
COL9A3Q14050 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
COL9A3Q14050 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
COL9A3Q14050 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
COL9A3Q14050 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
COL9A3Q14050 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
COL9A3Q14050 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
COL9A3Q14050 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
COL9A3Q14050 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
COL9A3Q14050 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
COL9A3Q14050 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
COL9A3Q14050 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
COL9A3Q14050 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
COL9A3Q14050 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
COL9A3Q14050 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
COL9A3Q14050 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
COL9A3Q14050 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
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