Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNA1CQ13936 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA1CQ13936 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNA1CQ13936 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNA1CQ13936 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNA1CQ13936 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CACNA1CQ13936 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNA1CQ13936 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNA1CQ13936 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA1CQ13936 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CACNA1CQ13936 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA1CQ13936 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA1CQ13936 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNA1CQ13936 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNA1CQ13936 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA1CQ13936 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNA1CQ13936 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA1CQ13936 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CACNA1CQ13936 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA1CQ13936 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA1CQ13936 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNA1CQ13936 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNA1CQ13936 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNA1CQ13936 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNA1CQ13936 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNA1CQ13936 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNA1CQ13936 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA1CQ13936 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA1CQ13936 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNA1CQ13936 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNA1CQ13936 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CACNA1CQ13936 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CACNA1CQ13936 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA1CQ13936 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA1CQ13936 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA1CQ13936 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA1CQ13936 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA1CQ13936 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA1CQ13936 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA1CQ13936 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA1CQ13936 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA1CQ13936 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA1CQ13936 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA1CQ13936 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNA1CQ13936 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA1CQ13936 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA1CQ13936 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA1CQ13936 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNA1CQ13936 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA1CQ13936 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA1CQ13936 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA1CQ13936 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA1CQ13936 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA1CQ13936 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNA1CQ13936 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA1CQ13936 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA1CQ13936 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNA1CQ13936 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA1CQ13936 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA1CQ13936 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CACNA1CQ13936 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CACNA1CQ13936 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA1CQ13936 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA1CQ13936 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA1CQ13936 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNA1CQ13936 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA1CQ13936 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA1CQ13936 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CACNA1CQ13936 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNA1CQ13936 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNA1CQ13936 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNA1CQ13936 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNA1CQ13936 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA1CQ13936 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA1CQ13936 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CACNA1CQ13936 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA1CQ13936 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNA1CQ13936 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA1CQ13936 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNA1CQ13936 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA1CQ13936 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNA1CQ13936 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNA1CQ13936 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNA1CQ13936 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNA1CQ13936 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA1CQ13936 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA1CQ13936 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNA1CQ13936 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA1CQ13936 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA1CQ13936 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA1CQ13936 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA1CQ13936 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNA1CQ13936 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA1CQ13936 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNA1CQ13936 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNA1CQ13936 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA1CQ13936 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNA1CQ13936 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA1CQ13936 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CACNA1CQ13936 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
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