Protein–RNA interactions for Protein: Q13571

LAPTM5, Lysosomal-associated transmembrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM5Q13571 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LAPTM5Q13571 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LAPTM5Q13571 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LAPTM5Q13571 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LAPTM5Q13571 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LAPTM5Q13571 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LAPTM5Q13571 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAPTM5Q13571 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LAPTM5Q13571 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LAPTM5Q13571 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAPTM5Q13571 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LAPTM5Q13571 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAPTM5Q13571 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LAPTM5Q13571 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAPTM5Q13571 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LAPTM5Q13571 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAPTM5Q13571 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LAPTM5Q13571 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAPTM5Q13571 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAPTM5Q13571 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LAPTM5Q13571 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAPTM5Q13571 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LAPTM5Q13571 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAPTM5Q13571 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAPTM5Q13571 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAPTM5Q13571 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LAPTM5Q13571 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LAPTM5Q13571 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LAPTM5Q13571 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LAPTM5Q13571 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAPTM5Q13571 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAPTM5Q13571 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAPTM5Q13571 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAPTM5Q13571 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LAPTM5Q13571 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAPTM5Q13571 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAPTM5Q13571 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAPTM5Q13571 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LAPTM5Q13571 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LAPTM5Q13571 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LAPTM5Q13571 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAPTM5Q13571 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LAPTM5Q13571 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LAPTM5Q13571 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LAPTM5Q13571 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LAPTM5Q13571 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAPTM5Q13571 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LAPTM5Q13571 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LAPTM5Q13571 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LAPTM5Q13571 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LAPTM5Q13571 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAPTM5Q13571 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAPTM5Q13571 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAPTM5Q13571 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LAPTM5Q13571 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAPTM5Q13571 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LAPTM5Q13571 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAPTM5Q13571 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAPTM5Q13571 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LAPTM5Q13571 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LAPTM5Q13571 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAPTM5Q13571 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAPTM5Q13571 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAPTM5Q13571 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LAPTM5Q13571 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAPTM5Q13571 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LAPTM5Q13571 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAPTM5Q13571 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LAPTM5Q13571 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAPTM5Q13571 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LAPTM5Q13571 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LAPTM5Q13571 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LAPTM5Q13571 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LAPTM5Q13571 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAPTM5Q13571 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAPTM5Q13571 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LAPTM5Q13571 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAPTM5Q13571 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAPTM5Q13571 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LAPTM5Q13571 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAPTM5Q13571 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAPTM5Q13571 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LAPTM5Q13571 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAPTM5Q13571 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LAPTM5Q13571 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAPTM5Q13571 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAPTM5Q13571 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAPTM5Q13571 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LAPTM5Q13571 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LAPTM5Q13571 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LAPTM5Q13571 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LAPTM5Q13571 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LAPTM5Q13571 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LAPTM5Q13571 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LAPTM5Q13571 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LAPTM5Q13571 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LAPTM5Q13571 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAPTM5Q13571 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LAPTM5Q13571 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LAPTM5Q13571 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms