Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SEMA3FQ13275 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SEMA3FQ13275 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
SEMA3FQ13275 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SEMA3FQ13275 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SEMA3FQ13275 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SEMA3FQ13275 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
SEMA3FQ13275 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SEMA3FQ13275 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SEMA3FQ13275 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SEMA3FQ13275 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SEMA3FQ13275 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SEMA3FQ13275 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SEMA3FQ13275 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SEMA3FQ13275 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SEMA3FQ13275 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SEMA3FQ13275 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SEMA3FQ13275 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SEMA3FQ13275 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SEMA3FQ13275 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SEMA3FQ13275 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SEMA3FQ13275 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SEMA3FQ13275 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SEMA3FQ13275 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SEMA3FQ13275 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SEMA3FQ13275 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SEMA3FQ13275 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SEMA3FQ13275 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SEMA3FQ13275 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
SEMA3FQ13275 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
SEMA3FQ13275 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SEMA3FQ13275 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SEMA3FQ13275 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SEMA3FQ13275 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SEMA3FQ13275 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SEMA3FQ13275 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SEMA3FQ13275 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
SEMA3FQ13275 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SEMA3FQ13275 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SEMA3FQ13275 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
SEMA3FQ13275 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SEMA3FQ13275 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
SEMA3FQ13275 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SEMA3FQ13275 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SEMA3FQ13275 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SEMA3FQ13275 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SEMA3FQ13275 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SEMA3FQ13275 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SEMA3FQ13275 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SEMA3FQ13275 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SEMA3FQ13275 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SEMA3FQ13275 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SEMA3FQ13275 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SEMA3FQ13275 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SEMA3FQ13275 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SEMA3FQ13275 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SEMA3FQ13275 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.61
SEMA3FQ13275 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SEMA3FQ13275 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SEMA3FQ13275 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SEMA3FQ13275 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SEMA3FQ13275 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SEMA3FQ13275 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SEMA3FQ13275 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
SEMA3FQ13275 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SEMA3FQ13275 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SEMA3FQ13275 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SEMA3FQ13275 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SEMA3FQ13275 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SEMA3FQ13275 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SEMA3FQ13275 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SEMA3FQ13275 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
SEMA3FQ13275 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SEMA3FQ13275 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SEMA3FQ13275 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SEMA3FQ13275 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SEMA3FQ13275 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SEMA3FQ13275 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SEMA3FQ13275 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SEMA3FQ13275 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SEMA3FQ13275 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SEMA3FQ13275 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SEMA3FQ13275 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SEMA3FQ13275 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
SEMA3FQ13275 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SEMA3FQ13275 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SEMA3FQ13275 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SEMA3FQ13275 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SEMA3FQ13275 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SEMA3FQ13275 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SEMA3FQ13275 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SEMA3FQ13275 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SEMA3FQ13275 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
SEMA3FQ13275 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SEMA3FQ13275 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SEMA3FQ13275 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SEMA3FQ13275 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SEMA3FQ13275 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SEMA3FQ13275 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SEMA3FQ13275 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
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