Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TRDNQ13061 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TRDNQ13061 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TRDNQ13061 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
TRDNQ13061 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TRDNQ13061 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TRDNQ13061 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TRDNQ13061 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TRDNQ13061 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
TRDNQ13061 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TRDNQ13061 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRDNQ13061 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
TRDNQ13061 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TRDNQ13061 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
TRDNQ13061 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TRDNQ13061 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
TRDNQ13061 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
TRDNQ13061 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TRDNQ13061 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TRDNQ13061 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
TRDNQ13061 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
TRDNQ13061 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
TRDNQ13061 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
TRDNQ13061 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
TRDNQ13061 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TRDNQ13061 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TRDNQ13061 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TRDNQ13061 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TRDNQ13061 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TRDNQ13061 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRDNQ13061 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRDNQ13061 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRDNQ13061 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TRDNQ13061 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TRDNQ13061 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
TRDNQ13061 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TRDNQ13061 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TRDNQ13061 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TRDNQ13061 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
TRDNQ13061 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TRDNQ13061 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TRDNQ13061 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TRDNQ13061 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TRDNQ13061 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TRDNQ13061 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TRDNQ13061 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TRDNQ13061 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TRDNQ13061 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TRDNQ13061 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TRDNQ13061 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TRDNQ13061 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TRDNQ13061 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
TRDNQ13061 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TRDNQ13061 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TRDNQ13061 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TRDNQ13061 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRDNQ13061 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
TRDNQ13061 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
TRDNQ13061 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRDNQ13061 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRDNQ13061 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRDNQ13061 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRDNQ13061 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRDNQ13061 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRDNQ13061 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRDNQ13061 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRDNQ13061 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRDNQ13061 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRDNQ13061 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRDNQ13061 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRDNQ13061 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRDNQ13061 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRDNQ13061 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
TRDNQ13061 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRDNQ13061 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRDNQ13061 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRDNQ13061 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRDNQ13061 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRDNQ13061 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRDNQ13061 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRDNQ13061 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TRDNQ13061 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TRDNQ13061 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
TRDNQ13061 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRDNQ13061 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
TRDNQ13061 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
TRDNQ13061 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
TRDNQ13061 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TRDNQ13061 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TRDNQ13061 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
TRDNQ13061 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TRDNQ13061 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TRDNQ13061 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TRDNQ13061 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TRDNQ13061 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRDNQ13061 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TRDNQ13061 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRDNQ13061 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TRDNQ13061 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TRDNQ13061 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
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