Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ACTN3Q08043 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ACTN3Q08043 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ACTN3Q08043 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ACTN3Q08043 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ACTN3Q08043 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ACTN3Q08043 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ACTN3Q08043 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ACTN3Q08043 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ACTN3Q08043 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ACTN3Q08043 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ACTN3Q08043 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ACTN3Q08043 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ACTN3Q08043 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ACTN3Q08043 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACTN3Q08043 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ACTN3Q08043 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ACTN3Q08043 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ACTN3Q08043 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ACTN3Q08043 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ACTN3Q08043 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ACTN3Q08043 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ACTN3Q08043 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ACTN3Q08043 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ACTN3Q08043 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ACTN3Q08043 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ACTN3Q08043 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ACTN3Q08043 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ACTN3Q08043 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ACTN3Q08043 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ACTN3Q08043 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ACTN3Q08043 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ACTN3Q08043 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ACTN3Q08043 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ACTN3Q08043 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ACTN3Q08043 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ACTN3Q08043 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ACTN3Q08043 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ACTN3Q08043 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ACTN3Q08043 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ACTN3Q08043 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ACTN3Q08043 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ACTN3Q08043 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ACTN3Q08043 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ACTN3Q08043 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ACTN3Q08043 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ACTN3Q08043 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ACTN3Q08043 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ACTN3Q08043 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ACTN3Q08043 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ACTN3Q08043 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ACTN3Q08043 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ACTN3Q08043 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ACTN3Q08043 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ACTN3Q08043 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ACTN3Q08043 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ACTN3Q08043 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ACTN3Q08043 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ACTN3Q08043 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ACTN3Q08043 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ACTN3Q08043 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ACTN3Q08043 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ACTN3Q08043 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ACTN3Q08043 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ACTN3Q08043 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ACTN3Q08043 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACTN3Q08043 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ACTN3Q08043 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ACTN3Q08043 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ACTN3Q08043 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ACTN3Q08043 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ACTN3Q08043 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ACTN3Q08043 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ACTN3Q08043 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ACTN3Q08043 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ACTN3Q08043 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ACTN3Q08043 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ACTN3Q08043 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACTN3Q08043 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACTN3Q08043 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACTN3Q08043 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACTN3Q08043 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ACTN3Q08043 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ACTN3Q08043 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ACTN3Q08043 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ACTN3Q08043 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ACTN3Q08043 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ACTN3Q08043 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ACTN3Q08043 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ACTN3Q08043 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ACTN3Q08043 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ACTN3Q08043 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ACTN3Q08043 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
ACTN3Q08043 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACTN3Q08043 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ACTN3Q08043 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ACTN3Q08043 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ACTN3Q08043 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACTN3Q08043 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ACTN3Q08043 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms