Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PITPNAQ00169 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PITPNAQ00169 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PITPNAQ00169 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PITPNAQ00169 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PITPNAQ00169 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PITPNAQ00169 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PITPNAQ00169 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PITPNAQ00169 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PITPNAQ00169 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PITPNAQ00169 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PITPNAQ00169 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PITPNAQ00169 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PITPNAQ00169 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PITPNAQ00169 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PITPNAQ00169 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PITPNAQ00169 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PITPNAQ00169 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PITPNAQ00169 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PITPNAQ00169 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PITPNAQ00169 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PITPNAQ00169 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PITPNAQ00169 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PITPNAQ00169 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PITPNAQ00169 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PITPNAQ00169 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PITPNAQ00169 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PITPNAQ00169 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PITPNAQ00169 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PITPNAQ00169 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PITPNAQ00169 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PITPNAQ00169 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PITPNAQ00169 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PITPNAQ00169 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PITPNAQ00169 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PITPNAQ00169 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PITPNAQ00169 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PITPNAQ00169 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PITPNAQ00169 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PITPNAQ00169 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PITPNAQ00169 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PITPNAQ00169 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PITPNAQ00169 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PITPNAQ00169 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PITPNAQ00169 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PITPNAQ00169 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PITPNAQ00169 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PITPNAQ00169 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PITPNAQ00169 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PITPNAQ00169 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PITPNAQ00169 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PITPNAQ00169 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PITPNAQ00169 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PITPNAQ00169 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PITPNAQ00169 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PITPNAQ00169 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PITPNAQ00169 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PITPNAQ00169 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PITPNAQ00169 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PITPNAQ00169 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PITPNAQ00169 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PITPNAQ00169 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PITPNAQ00169 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PITPNAQ00169 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITPNAQ00169 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PITPNAQ00169 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PITPNAQ00169 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PITPNAQ00169 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PITPNAQ00169 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PITPNAQ00169 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PITPNAQ00169 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PITPNAQ00169 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PITPNAQ00169 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PITPNAQ00169 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PITPNAQ00169 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PITPNAQ00169 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PITPNAQ00169 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PITPNAQ00169 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PITPNAQ00169 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PITPNAQ00169 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PITPNAQ00169 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PITPNAQ00169 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PITPNAQ00169 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PITPNAQ00169 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PITPNAQ00169 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PITPNAQ00169 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PITPNAQ00169 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PITPNAQ00169 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PITPNAQ00169 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PITPNAQ00169 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PITPNAQ00169 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PITPNAQ00169 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PITPNAQ00169 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PITPNAQ00169 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PITPNAQ00169 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PITPNAQ00169 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PITPNAQ00169 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PITPNAQ00169 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PITPNAQ00169 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PITPNAQ00169 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms