Protein–RNA interactions for Protein: Q00005

PPP2R2B, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R2BQ00005 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPP2R2BQ00005 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPP2R2BQ00005 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPP2R2BQ00005 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PPP2R2BQ00005 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP2R2BQ00005 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP2R2BQ00005 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PPP2R2BQ00005 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPP2R2BQ00005 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPP2R2BQ00005 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PPP2R2BQ00005 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PPP2R2BQ00005 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PPP2R2BQ00005 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PPP2R2BQ00005 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPP2R2BQ00005 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PPP2R2BQ00005 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PPP2R2BQ00005 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PPP2R2BQ00005 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PPP2R2BQ00005 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPP2R2BQ00005 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPP2R2BQ00005 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PPP2R2BQ00005 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PPP2R2BQ00005 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PPP2R2BQ00005 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP2R2BQ00005 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP2R2BQ00005 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP2R2BQ00005 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PPP2R2BQ00005 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PPP2R2BQ00005 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP2R2BQ00005 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PPP2R2BQ00005 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PPP2R2BQ00005 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPP2R2BQ00005 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PPP2R2BQ00005 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP2R2BQ00005 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP2R2BQ00005 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPP2R2BQ00005 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP2R2BQ00005 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP2R2BQ00005 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PPP2R2BQ00005 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPP2R2BQ00005 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPP2R2BQ00005 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PPP2R2BQ00005 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPP2R2BQ00005 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPP2R2BQ00005 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPP2R2BQ00005 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PPP2R2BQ00005 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PPP2R2BQ00005 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPP2R2BQ00005 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPP2R2BQ00005 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPP2R2BQ00005 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPP2R2BQ00005 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPP2R2BQ00005 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPP2R2BQ00005 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PPP2R2BQ00005 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPP2R2BQ00005 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPP2R2BQ00005 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PPP2R2BQ00005 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPP2R2BQ00005 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPP2R2BQ00005 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPP2R2BQ00005 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPP2R2BQ00005 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPP2R2BQ00005 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPP2R2BQ00005 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP2R2BQ00005 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP2R2BQ00005 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP2R2BQ00005 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP2R2BQ00005 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP2R2BQ00005 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP2R2BQ00005 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP2R2BQ00005 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP2R2BQ00005 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP2R2BQ00005 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP2R2BQ00005 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP2R2BQ00005 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP2R2BQ00005 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP2R2BQ00005 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PPP2R2BQ00005 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PPP2R2BQ00005 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP2R2BQ00005 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP2R2BQ00005 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP2R2BQ00005 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP2R2BQ00005 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP2R2BQ00005 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP2R2BQ00005 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP2R2BQ00005 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP2R2BQ00005 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP2R2BQ00005 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPP2R2BQ00005 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPP2R2BQ00005 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP2R2BQ00005 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP2R2BQ00005 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP2R2BQ00005 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP2R2BQ00005 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP2R2BQ00005 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP2R2BQ00005 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP2R2BQ00005 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP2R2BQ00005 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPP2R2BQ00005 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPP2R2BQ00005 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms