Protein–RNA interactions for Protein: P78330

PSPH, Phosphoserine phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPHP78330 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSPHP78330 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSPHP78330 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSPHP78330 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSPHP78330 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSPHP78330 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSPHP78330 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSPHP78330 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSPHP78330 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSPHP78330 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSPHP78330 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSPHP78330 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSPHP78330 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSPHP78330 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSPHP78330 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSPHP78330 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSPHP78330 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PSPHP78330 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSPHP78330 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSPHP78330 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSPHP78330 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSPHP78330 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSPHP78330 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSPHP78330 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSPHP78330 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSPHP78330 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSPHP78330 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSPHP78330 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PSPHP78330 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PSPHP78330 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PSPHP78330 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSPHP78330 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSPHP78330 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PSPHP78330 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PSPHP78330 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PSPHP78330 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PSPHP78330 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSPHP78330 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSPHP78330 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PSPHP78330 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSPHP78330 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSPHP78330 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSPHP78330 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSPHP78330 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSPHP78330 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSPHP78330 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSPHP78330 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSPHP78330 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSPHP78330 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSPHP78330 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSPHP78330 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSPHP78330 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSPHP78330 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSPHP78330 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSPHP78330 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSPHP78330 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSPHP78330 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSPHP78330 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSPHP78330 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSPHP78330 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSPHP78330 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSPHP78330 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSPHP78330 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSPHP78330 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSPHP78330 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PSPHP78330 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSPHP78330 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSPHP78330 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSPHP78330 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSPHP78330 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSPHP78330 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSPHP78330 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSPHP78330 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSPHP78330 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSPHP78330 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PSPHP78330 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSPHP78330 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSPHP78330 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSPHP78330 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSPHP78330 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSPHP78330 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSPHP78330 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSPHP78330 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSPHP78330 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSPHP78330 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSPHP78330 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSPHP78330 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSPHP78330 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSPHP78330 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSPHP78330 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSPHP78330 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSPHP78330 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSPHP78330 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PSPHP78330 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSPHP78330 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSPHP78330 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PSPHP78330 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSPHP78330 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSPHP78330 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSPHP78330 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms