Protein–RNA interactions for Protein: P63010

AP2B1, AP-2 complex subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2B1P63010 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
AP2B1P63010 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AP2B1P63010 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AP2B1P63010 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
AP2B1P63010 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
AP2B1P63010 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
AP2B1P63010 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AP2B1P63010 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AP2B1P63010 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AP2B1P63010 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AP2B1P63010 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
AP2B1P63010 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AP2B1P63010 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AP2B1P63010 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AP2B1P63010 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AP2B1P63010 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AP2B1P63010 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AP2B1P63010 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AP2B1P63010 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AP2B1P63010 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AP2B1P63010 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AP2B1P63010 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AP2B1P63010 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AP2B1P63010 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AP2B1P63010 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AP2B1P63010 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AP2B1P63010 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AP2B1P63010 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AP2B1P63010 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27■■□□□ 1.91
AP2B1P63010 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AP2B1P63010 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AP2B1P63010 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AP2B1P63010 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AP2B1P63010 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AP2B1P63010 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
AP2B1P63010 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
AP2B1P63010 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
AP2B1P63010 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AP2B1P63010 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AP2B1P63010 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AP2B1P63010 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
AP2B1P63010 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
AP2B1P63010 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AP2B1P63010 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AP2B1P63010 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AP2B1P63010 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
AP2B1P63010 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
AP2B1P63010 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
AP2B1P63010 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AP2B1P63010 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
AP2B1P63010 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AP2B1P63010 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
AP2B1P63010 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
AP2B1P63010 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AP2B1P63010 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AP2B1P63010 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
AP2B1P63010 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
AP2B1P63010 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
AP2B1P63010 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
AP2B1P63010 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
AP2B1P63010 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AP2B1P63010 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AP2B1P63010 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AP2B1P63010 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AP2B1P63010 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
AP2B1P63010 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AP2B1P63010 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AP2B1P63010 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AP2B1P63010 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AP2B1P63010 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AP2B1P63010 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AP2B1P63010 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
AP2B1P63010 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AP2B1P63010 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
AP2B1P63010 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
AP2B1P63010 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
AP2B1P63010 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AP2B1P63010 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AP2B1P63010 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AP2B1P63010 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AP2B1P63010 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
AP2B1P63010 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AP2B1P63010 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
AP2B1P63010 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
AP2B1P63010 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AP2B1P63010 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AP2B1P63010 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AP2B1P63010 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AP2B1P63010 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AP2B1P63010 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AP2B1P63010 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AP2B1P63010 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AP2B1P63010 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AP2B1P63010 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AP2B1P63010 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AP2B1P63010 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AP2B1P63010 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AP2B1P63010 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AP2B1P63010 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AP2B1P63010 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms