Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE2MP61081 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2MP61081 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2MP61081 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE2MP61081 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2MP61081 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE2MP61081 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2MP61081 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2MP61081 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE2MP61081 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBE2MP61081 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBE2MP61081 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2MP61081 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2MP61081 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2MP61081 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2MP61081 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2MP61081 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2MP61081 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2MP61081 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2MP61081 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2MP61081 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2MP61081 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2MP61081 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2MP61081 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2MP61081 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2MP61081 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2MP61081 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE2MP61081 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE2MP61081 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2MP61081 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE2MP61081 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2MP61081 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE2MP61081 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2MP61081 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2MP61081 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE2MP61081 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2MP61081 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBE2MP61081 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2MP61081 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2MP61081 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2MP61081 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2MP61081 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBE2MP61081 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2MP61081 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2MP61081 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBE2MP61081 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2MP61081 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UBE2MP61081 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE2MP61081 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE2MP61081 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE2MP61081 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE2MP61081 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE2MP61081 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBE2MP61081 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2MP61081 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2MP61081 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2MP61081 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2MP61081 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBE2MP61081 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2MP61081 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2MP61081 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2MP61081 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2MP61081 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2MP61081 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2MP61081 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2MP61081 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2MP61081 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2MP61081 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UBE2MP61081 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2MP61081 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2MP61081 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UBE2MP61081 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2MP61081 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2MP61081 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2MP61081 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2MP61081 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2MP61081 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2MP61081 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2MP61081 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2MP61081 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2MP61081 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2MP61081 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2MP61081 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2MP61081 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2MP61081 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2MP61081 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2MP61081 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2MP61081 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2MP61081 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2MP61081 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2MP61081 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2MP61081 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2MP61081 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2MP61081 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2MP61081 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2MP61081 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2MP61081 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2MP61081 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2MP61081 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE2MP61081 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms