Protein–RNA interactions for Protein: P61018

RAB4B, Ras-related protein Rab-4B, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4BP61018 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB4BP61018 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RAB4BP61018 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAB4BP61018 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB4BP61018 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB4BP61018 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB4BP61018 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB4BP61018 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB4BP61018 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB4BP61018 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB4BP61018 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB4BP61018 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB4BP61018 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB4BP61018 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB4BP61018 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB4BP61018 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB4BP61018 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB4BP61018 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB4BP61018 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB4BP61018 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB4BP61018 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB4BP61018 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB4BP61018 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB4BP61018 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB4BP61018 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB4BP61018 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAB4BP61018 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB4BP61018 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB4BP61018 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAB4BP61018 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAB4BP61018 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RAB4BP61018 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAB4BP61018 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB4BP61018 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB4BP61018 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB4BP61018 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB4BP61018 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB4BP61018 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB4BP61018 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RAB4BP61018 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB4BP61018 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB4BP61018 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB4BP61018 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB4BP61018 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB4BP61018 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB4BP61018 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB4BP61018 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB4BP61018 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB4BP61018 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB4BP61018 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB4BP61018 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RAB4BP61018 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB4BP61018 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB4BP61018 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB4BP61018 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB4BP61018 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB4BP61018 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB4BP61018 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB4BP61018 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB4BP61018 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB4BP61018 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB4BP61018 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB4BP61018 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB4BP61018 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAB4BP61018 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAB4BP61018 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB4BP61018 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAB4BP61018 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB4BP61018 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB4BP61018 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAB4BP61018 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB4BP61018 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB4BP61018 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB4BP61018 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB4BP61018 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB4BP61018 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB4BP61018 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB4BP61018 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB4BP61018 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAB4BP61018 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB4BP61018 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB4BP61018 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB4BP61018 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB4BP61018 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB4BP61018 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB4BP61018 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB4BP61018 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB4BP61018 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB4BP61018 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB4BP61018 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB4BP61018 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB4BP61018 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB4BP61018 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RAB4BP61018 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB4BP61018 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB4BP61018 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB4BP61018 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB4BP61018 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB4BP61018 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB4BP61018 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms