Protein–RNA interactions for Protein: P61018

RAB4B, Ras-related protein Rab-4B, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4BP61018 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAB4BP61018 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB4BP61018 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB4BP61018 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB4BP61018 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB4BP61018 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAB4BP61018 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAB4BP61018 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB4BP61018 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB4BP61018 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB4BP61018 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB4BP61018 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB4BP61018 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RAB4BP61018 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RAB4BP61018 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RAB4BP61018 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB4BP61018 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB4BP61018 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB4BP61018 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB4BP61018 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB4BP61018 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB4BP61018 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB4BP61018 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB4BP61018 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB4BP61018 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB4BP61018 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB4BP61018 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB4BP61018 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB4BP61018 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB4BP61018 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB4BP61018 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB4BP61018 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB4BP61018 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB4BP61018 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB4BP61018 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB4BP61018 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB4BP61018 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB4BP61018 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB4BP61018 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB4BP61018 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB4BP61018 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB4BP61018 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB4BP61018 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB4BP61018 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB4BP61018 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB4BP61018 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB4BP61018 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB4BP61018 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB4BP61018 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB4BP61018 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB4BP61018 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB4BP61018 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB4BP61018 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB4BP61018 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB4BP61018 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB4BP61018 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB4BP61018 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB4BP61018 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB4BP61018 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB4BP61018 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB4BP61018 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB4BP61018 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB4BP61018 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB4BP61018 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB4BP61018 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB4BP61018 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB4BP61018 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB4BP61018 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB4BP61018 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB4BP61018 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB4BP61018 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB4BP61018 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB4BP61018 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB4BP61018 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB4BP61018 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB4BP61018 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB4BP61018 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB4BP61018 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB4BP61018 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB4BP61018 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB4BP61018 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB4BP61018 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB4BP61018 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB4BP61018 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB4BP61018 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB4BP61018 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB4BP61018 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB4BP61018 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB4BP61018 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB4BP61018 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB4BP61018 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB4BP61018 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB4BP61018 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB4BP61018 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB4BP61018 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB4BP61018 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB4BP61018 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB4BP61018 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB4BP61018 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB4BP61018 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 239.1 ms