Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM3BP58499 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM3BP58499 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM3BP58499 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM3BP58499 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM3BP58499 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM3BP58499 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM3BP58499 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM3BP58499 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM3BP58499 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM3BP58499 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM3BP58499 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM3BP58499 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM3BP58499 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM3BP58499 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM3BP58499 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM3BP58499 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM3BP58499 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM3BP58499 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM3BP58499 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM3BP58499 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM3BP58499 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM3BP58499 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM3BP58499 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM3BP58499 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM3BP58499 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM3BP58499 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM3BP58499 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM3BP58499 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM3BP58499 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM3BP58499 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM3BP58499 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM3BP58499 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM3BP58499 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM3BP58499 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM3BP58499 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM3BP58499 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM3BP58499 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM3BP58499 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM3BP58499 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FAM3BP58499 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM3BP58499 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAM3BP58499 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM3BP58499 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FAM3BP58499 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM3BP58499 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FAM3BP58499 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM3BP58499 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM3BP58499 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM3BP58499 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FAM3BP58499 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FAM3BP58499 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM3BP58499 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAM3BP58499 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM3BP58499 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM3BP58499 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAM3BP58499 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAM3BP58499 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM3BP58499 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAM3BP58499 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM3BP58499 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM3BP58499 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM3BP58499 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAM3BP58499 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM3BP58499 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM3BP58499 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM3BP58499 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM3BP58499 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM3BP58499 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM3BP58499 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM3BP58499 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM3BP58499 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM3BP58499 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM3BP58499 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM3BP58499 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAM3BP58499 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAM3BP58499 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM3BP58499 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAM3BP58499 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAM3BP58499 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM3BP58499 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM3BP58499 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM3BP58499 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM3BP58499 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM3BP58499 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FAM3BP58499 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
FAM3BP58499 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FAM3BP58499 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM3BP58499 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM3BP58499 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM3BP58499 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM3BP58499 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM3BP58499 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM3BP58499 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FAM3BP58499 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
FAM3BP58499 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
FAM3BP58499 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM3BP58499 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
FAM3BP58499 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM3BP58499 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms