Protein–RNA interactions for Protein: P56880

CLDN20, Claudin-20, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN20P56880 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN20P56880 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN20P56880 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CLDN20P56880 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDN20P56880 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDN20P56880 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLDN20P56880 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN20P56880 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN20P56880 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN20P56880 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDN20P56880 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDN20P56880 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDN20P56880 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDN20P56880 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN20P56880 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN20P56880 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDN20P56880 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDN20P56880 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDN20P56880 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN20P56880 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN20P56880 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN20P56880 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLDN20P56880 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLDN20P56880 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDN20P56880 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDN20P56880 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDN20P56880 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLDN20P56880 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDN20P56880 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDN20P56880 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDN20P56880 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CLDN20P56880 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLDN20P56880 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLDN20P56880 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDN20P56880 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN20P56880 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN20P56880 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLDN20P56880 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLDN20P56880 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLDN20P56880 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLDN20P56880 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN20P56880 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CLDN20P56880 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN20P56880 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CLDN20P56880 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN20P56880 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN20P56880 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN20P56880 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLDN20P56880 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLDN20P56880 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CLDN20P56880 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN20P56880 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN20P56880 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN20P56880 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN20P56880 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CLDN20P56880 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN20P56880 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN20P56880 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN20P56880 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CLDN20P56880 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CLDN20P56880 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDN20P56880 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDN20P56880 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDN20P56880 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDN20P56880 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CLDN20P56880 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN20P56880 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN20P56880 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CLDN20P56880 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN20P56880 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN20P56880 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLDN20P56880 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN20P56880 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN20P56880 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLDN20P56880 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN20P56880 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLDN20P56880 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CLDN20P56880 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLDN20P56880 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLDN20P56880 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN20P56880 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CLDN20P56880 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN20P56880 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN20P56880 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN20P56880 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLDN20P56880 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN20P56880 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLDN20P56880 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDN20P56880 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLDN20P56880 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLDN20P56880 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN20P56880 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CLDN20P56880 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN20P56880 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLDN20P56880 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN20P56880 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLDN20P56880 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN20P56880 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN20P56880 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN20P56880 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.6 ms