Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MTCP1P56278 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTCP1P56278 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTCP1P56278 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTCP1P56278 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MTCP1P56278 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTCP1P56278 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MTCP1P56278 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MTCP1P56278 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MTCP1P56278 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MTCP1P56278 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MTCP1P56278 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTCP1P56278 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MTCP1P56278 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTCP1P56278 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTCP1P56278 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTCP1P56278 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MTCP1P56278 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTCP1P56278 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MTCP1P56278 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MTCP1P56278 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MTCP1P56278 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTCP1P56278 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MTCP1P56278 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTCP1P56278 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTCP1P56278 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTCP1P56278 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MTCP1P56278 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTCP1P56278 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTCP1P56278 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTCP1P56278 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTCP1P56278 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTCP1P56278 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTCP1P56278 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTCP1P56278 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTCP1P56278 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTCP1P56278 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTCP1P56278 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTCP1P56278 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTCP1P56278 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTCP1P56278 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTCP1P56278 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MTCP1P56278 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTCP1P56278 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTCP1P56278 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTCP1P56278 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MTCP1P56278 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTCP1P56278 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTCP1P56278 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MTCP1P56278 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTCP1P56278 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTCP1P56278 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTCP1P56278 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTCP1P56278 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTCP1P56278 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTCP1P56278 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTCP1P56278 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTCP1P56278 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTCP1P56278 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTCP1P56278 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTCP1P56278 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTCP1P56278 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTCP1P56278 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTCP1P56278 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MTCP1P56278 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTCP1P56278 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTCP1P56278 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTCP1P56278 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTCP1P56278 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTCP1P56278 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTCP1P56278 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTCP1P56278 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTCP1P56278 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MTCP1P56278 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTCP1P56278 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTCP1P56278 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTCP1P56278 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTCP1P56278 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTCP1P56278 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTCP1P56278 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTCP1P56278 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTCP1P56278 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MTCP1P56278 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MTCP1P56278 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTCP1P56278 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTCP1P56278 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTCP1P56278 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTCP1P56278 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTCP1P56278 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTCP1P56278 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTCP1P56278 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTCP1P56278 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTCP1P56278 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTCP1P56278 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTCP1P56278 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTCP1P56278 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTCP1P56278 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTCP1P56278 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTCP1P56278 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTCP1P56278 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms