Protein–RNA interactions for Protein: P55075

FGF8, Fibroblast growth factor 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF8P55075 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FGF8P55075 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FGF8P55075 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FGF8P55075 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FGF8P55075 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FGF8P55075 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FGF8P55075 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGF8P55075 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FGF8P55075 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGF8P55075 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FGF8P55075 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FGF8P55075 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGF8P55075 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FGF8P55075 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGF8P55075 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FGF8P55075 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGF8P55075 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGF8P55075 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FGF8P55075 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGF8P55075 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGF8P55075 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FGF8P55075 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGF8P55075 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGF8P55075 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FGF8P55075 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGF8P55075 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGF8P55075 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGF8P55075 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FGF8P55075 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGF8P55075 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGF8P55075 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FGF8P55075 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGF8P55075 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FGF8P55075 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGF8P55075 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGF8P55075 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGF8P55075 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FGF8P55075 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FGF8P55075 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FGF8P55075 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FGF8P55075 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FGF8P55075 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FGF8P55075 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGF8P55075 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGF8P55075 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FGF8P55075 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGF8P55075 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGF8P55075 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FGF8P55075 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGF8P55075 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGF8P55075 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGF8P55075 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGF8P55075 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FGF8P55075 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGF8P55075 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FGF8P55075 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGF8P55075 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FGF8P55075 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGF8P55075 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FGF8P55075 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGF8P55075 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGF8P55075 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGF8P55075 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FGF8P55075 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGF8P55075 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FGF8P55075 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGF8P55075 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGF8P55075 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FGF8P55075 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FGF8P55075 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FGF8P55075 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGF8P55075 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGF8P55075 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGF8P55075 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FGF8P55075 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FGF8P55075 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FGF8P55075 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGF8P55075 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGF8P55075 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FGF8P55075 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FGF8P55075 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGF8P55075 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FGF8P55075 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGF8P55075 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGF8P55075 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGF8P55075 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FGF8P55075 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGF8P55075 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGF8P55075 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FGF8P55075 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGF8P55075 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGF8P55075 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGF8P55075 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGF8P55075 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGF8P55075 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGF8P55075 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGF8P55075 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGF8P55075 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGF8P55075 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FGF8P55075 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms