Protein–RNA interactions for Protein: P52179

MYOM1, Myomesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOM1P52179 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
MYOM1P52179 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
MYOM1P52179 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
MYOM1P52179 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
MYOM1P52179 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
MYOM1P52179 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
MYOM1P52179 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
MYOM1P52179 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
MYOM1P52179 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
MYOM1P52179 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
MYOM1P52179 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
MYOM1P52179 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
MYOM1P52179 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
MYOM1P52179 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
MYOM1P52179 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
MYOM1P52179 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
MYOM1P52179 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
MYOM1P52179 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
MYOM1P52179 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
MYOM1P52179 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
MYOM1P52179 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
MYOM1P52179 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
MYOM1P52179 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
MYOM1P52179 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
MYOM1P52179 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
MYOM1P52179 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
MYOM1P52179 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
MYOM1P52179 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
MYOM1P52179 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC38.33■■■■□ 3.73
MYOM1P52179 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
MYOM1P52179 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
MYOM1P52179 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
MYOM1P52179 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
MYOM1P52179 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
MYOM1P52179 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
MYOM1P52179 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
MYOM1P52179 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
MYOM1P52179 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
MYOM1P52179 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
MYOM1P52179 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
MYOM1P52179 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
MYOM1P52179 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
MYOM1P52179 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
MYOM1P52179 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
MYOM1P52179 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
MYOM1P52179 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
MYOM1P52179 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC38.07■■■■□ 3.69
MYOM1P52179 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
MYOM1P52179 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
MYOM1P52179 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
MYOM1P52179 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
MYOM1P52179 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
MYOM1P52179 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
MYOM1P52179 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
MYOM1P52179 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
MYOM1P52179 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
MYOM1P52179 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
MYOM1P52179 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
MYOM1P52179 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
MYOM1P52179 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
MYOM1P52179 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
MYOM1P52179 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
MYOM1P52179 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
MYOM1P52179 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
MYOM1P52179 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
MYOM1P52179 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
MYOM1P52179 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
MYOM1P52179 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
MYOM1P52179 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
MYOM1P52179 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
MYOM1P52179 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
MYOM1P52179 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
MYOM1P52179 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
MYOM1P52179 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
MYOM1P52179 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
MYOM1P52179 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
MYOM1P52179 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
MYOM1P52179 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
MYOM1P52179 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
MYOM1P52179 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
MYOM1P52179 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
MYOM1P52179 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
MYOM1P52179 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
MYOM1P52179 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
MYOM1P52179 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
MYOM1P52179 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
MYOM1P52179 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
MYOM1P52179 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
MYOM1P52179 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
MYOM1P52179 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
MYOM1P52179 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
MYOM1P52179 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
MYOM1P52179 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
MYOM1P52179 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
MYOM1P52179 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
MYOM1P52179 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
MYOM1P52179 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
MYOM1P52179 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
MYOM1P52179 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
MYOM1P52179 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 665.6 ms