Protein–RNA interactions for Protein: P49840

GSK3A, Glycogen synthase kinase-3 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3AP49840 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSK3AP49840 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GSK3AP49840 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GSK3AP49840 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GSK3AP49840 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GSK3AP49840 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GSK3AP49840 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GSK3AP49840 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GSK3AP49840 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GSK3AP49840 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GSK3AP49840 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GSK3AP49840 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GSK3AP49840 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSK3AP49840 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GSK3AP49840 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GSK3AP49840 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GSK3AP49840 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GSK3AP49840 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GSK3AP49840 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GSK3AP49840 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GSK3AP49840 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GSK3AP49840 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GSK3AP49840 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GSK3AP49840 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GSK3AP49840 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GSK3AP49840 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GSK3AP49840 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GSK3AP49840 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GSK3AP49840 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GSK3AP49840 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GSK3AP49840 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GSK3AP49840 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GSK3AP49840 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GSK3AP49840 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
GSK3AP49840 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GSK3AP49840 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSK3AP49840 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GSK3AP49840 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GSK3AP49840 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GSK3AP49840 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GSK3AP49840 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GSK3AP49840 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GSK3AP49840 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GSK3AP49840 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GSK3AP49840 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GSK3AP49840 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GSK3AP49840 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GSK3AP49840 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GSK3AP49840 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GSK3AP49840 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GSK3AP49840 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GSK3AP49840 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GSK3AP49840 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GSK3AP49840 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GSK3AP49840 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GSK3AP49840 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSK3AP49840 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSK3AP49840 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GSK3AP49840 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GSK3AP49840 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GSK3AP49840 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GSK3AP49840 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GSK3AP49840 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GSK3AP49840 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GSK3AP49840 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GSK3AP49840 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GSK3AP49840 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GSK3AP49840 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GSK3AP49840 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GSK3AP49840 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GSK3AP49840 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GSK3AP49840 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GSK3AP49840 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GSK3AP49840 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GSK3AP49840 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GSK3AP49840 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GSK3AP49840 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GSK3AP49840 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GSK3AP49840 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSK3AP49840 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSK3AP49840 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSK3AP49840 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSK3AP49840 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GSK3AP49840 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GSK3AP49840 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GSK3AP49840 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GSK3AP49840 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GSK3AP49840 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSK3AP49840 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GSK3AP49840 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GSK3AP49840 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GSK3AP49840 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GSK3AP49840 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSK3AP49840 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSK3AP49840 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSK3AP49840 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSK3AP49840 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GSK3AP49840 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GSK3AP49840 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GSK3AP49840 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.7 ms