Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRP9P49458 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRP9P49458 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRP9P49458 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SRP9P49458 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SRP9P49458 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRP9P49458 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRP9P49458 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SRP9P49458 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRP9P49458 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRP9P49458 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRP9P49458 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRP9P49458 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRP9P49458 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRP9P49458 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SRP9P49458 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SRP9P49458 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SRP9P49458 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRP9P49458 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SRP9P49458 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRP9P49458 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SRP9P49458 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRP9P49458 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SRP9P49458 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SRP9P49458 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRP9P49458 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRP9P49458 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SRP9P49458 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRP9P49458 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SRP9P49458 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRP9P49458 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRP9P49458 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SRP9P49458 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRP9P49458 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SRP9P49458 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRP9P49458 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRP9P49458 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SRP9P49458 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SRP9P49458 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SRP9P49458 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SRP9P49458 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SRP9P49458 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRP9P49458 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SRP9P49458 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRP9P49458 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRP9P49458 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRP9P49458 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SRP9P49458 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRP9P49458 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRP9P49458 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRP9P49458 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRP9P49458 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRP9P49458 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRP9P49458 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRP9P49458 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRP9P49458 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRP9P49458 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRP9P49458 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRP9P49458 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRP9P49458 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRP9P49458 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRP9P49458 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SRP9P49458 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRP9P49458 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRP9P49458 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRP9P49458 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRP9P49458 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRP9P49458 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SRP9P49458 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRP9P49458 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRP9P49458 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRP9P49458 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SRP9P49458 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRP9P49458 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRP9P49458 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRP9P49458 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRP9P49458 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRP9P49458 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRP9P49458 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRP9P49458 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRP9P49458 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRP9P49458 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRP9P49458 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRP9P49458 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRP9P49458 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SRP9P49458 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRP9P49458 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRP9P49458 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRP9P49458 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRP9P49458 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRP9P49458 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRP9P49458 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRP9P49458 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRP9P49458 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRP9P49458 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRP9P49458 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRP9P49458 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRP9P49458 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRP9P49458 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRP9P49458 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms