Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CYLC1P35663 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CYLC1P35663 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CYLC1P35663 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CYLC1P35663 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CYLC1P35663 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CYLC1P35663 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CYLC1P35663 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CYLC1P35663 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CYLC1P35663 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CYLC1P35663 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CYLC1P35663 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CYLC1P35663 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CYLC1P35663 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CYLC1P35663 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CYLC1P35663 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CYLC1P35663 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CYLC1P35663 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CYLC1P35663 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CYLC1P35663 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CYLC1P35663 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CYLC1P35663 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CYLC1P35663 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CYLC1P35663 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CYLC1P35663 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CYLC1P35663 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CYLC1P35663 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CYLC1P35663 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CYLC1P35663 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CYLC1P35663 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CYLC1P35663 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CYLC1P35663 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CYLC1P35663 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CYLC1P35663 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CYLC1P35663 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CYLC1P35663 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CYLC1P35663 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CYLC1P35663 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CYLC1P35663 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CYLC1P35663 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CYLC1P35663 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CYLC1P35663 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CYLC1P35663 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CYLC1P35663 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CYLC1P35663 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CYLC1P35663 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CYLC1P35663 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CYLC1P35663 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CYLC1P35663 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CYLC1P35663 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CYLC1P35663 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CYLC1P35663 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CYLC1P35663 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CYLC1P35663 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CYLC1P35663 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CYLC1P35663 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CYLC1P35663 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CYLC1P35663 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CYLC1P35663 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CYLC1P35663 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CYLC1P35663 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CYLC1P35663 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CYLC1P35663 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CYLC1P35663 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CYLC1P35663 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CYLC1P35663 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CYLC1P35663 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CYLC1P35663 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CYLC1P35663 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CYLC1P35663 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CYLC1P35663 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CYLC1P35663 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CYLC1P35663 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CYLC1P35663 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CYLC1P35663 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CYLC1P35663 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CYLC1P35663 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CYLC1P35663 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CYLC1P35663 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CYLC1P35663 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CYLC1P35663 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CYLC1P35663 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CYLC1P35663 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CYLC1P35663 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CYLC1P35663 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CYLC1P35663 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CYLC1P35663 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CYLC1P35663 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CYLC1P35663 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CYLC1P35663 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CYLC1P35663 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CYLC1P35663 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CYLC1P35663 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CYLC1P35663 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CYLC1P35663 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CYLC1P35663 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CYLC1P35663 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CYLC1P35663 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CYLC1P35663 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CYLC1P35663 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms