Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CYLC1P35663 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
CYLC1P35663 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CYLC1P35663 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CYLC1P35663 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CYLC1P35663 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
CYLC1P35663 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CYLC1P35663 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
CYLC1P35663 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CYLC1P35663 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CYLC1P35663 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CYLC1P35663 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
CYLC1P35663 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CYLC1P35663 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CYLC1P35663 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CYLC1P35663 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CYLC1P35663 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CYLC1P35663 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CYLC1P35663 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CYLC1P35663 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CYLC1P35663 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CYLC1P35663 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CYLC1P35663 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CYLC1P35663 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CYLC1P35663 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CYLC1P35663 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CYLC1P35663 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CYLC1P35663 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CYLC1P35663 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CYLC1P35663 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CYLC1P35663 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
CYLC1P35663 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CYLC1P35663 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CYLC1P35663 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CYLC1P35663 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CYLC1P35663 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CYLC1P35663 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CYLC1P35663 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CYLC1P35663 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CYLC1P35663 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CYLC1P35663 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CYLC1P35663 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CYLC1P35663 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CYLC1P35663 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CYLC1P35663 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CYLC1P35663 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CYLC1P35663 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CYLC1P35663 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CYLC1P35663 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CYLC1P35663 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CYLC1P35663 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CYLC1P35663 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CYLC1P35663 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CYLC1P35663 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CYLC1P35663 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CYLC1P35663 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CYLC1P35663 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CYLC1P35663 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CYLC1P35663 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CYLC1P35663 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CYLC1P35663 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CYLC1P35663 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CYLC1P35663 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CYLC1P35663 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CYLC1P35663 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CYLC1P35663 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CYLC1P35663 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CYLC1P35663 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CYLC1P35663 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CYLC1P35663 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CYLC1P35663 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CYLC1P35663 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CYLC1P35663 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CYLC1P35663 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CYLC1P35663 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CYLC1P35663 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
CYLC1P35663 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
CYLC1P35663 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CYLC1P35663 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CYLC1P35663 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CYLC1P35663 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CYLC1P35663 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CYLC1P35663 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CYLC1P35663 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CYLC1P35663 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
CYLC1P35663 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CYLC1P35663 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
CYLC1P35663 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CYLC1P35663 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CYLC1P35663 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CYLC1P35663 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CYLC1P35663 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CYLC1P35663 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CYLC1P35663 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CYLC1P35663 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CYLC1P35663 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CYLC1P35663 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CYLC1P35663 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CYLC1P35663 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CYLC1P35663 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms