Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCVRNP35243 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCVRNP35243 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCVRNP35243 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCVRNP35243 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCVRNP35243 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCVRNP35243 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RCVRNP35243 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCVRNP35243 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RCVRNP35243 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCVRNP35243 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCVRNP35243 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RCVRNP35243 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RCVRNP35243 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RCVRNP35243 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RCVRNP35243 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RCVRNP35243 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCVRNP35243 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCVRNP35243 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RCVRNP35243 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCVRNP35243 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCVRNP35243 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCVRNP35243 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RCVRNP35243 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RCVRNP35243 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCVRNP35243 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCVRNP35243 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCVRNP35243 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCVRNP35243 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RCVRNP35243 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RCVRNP35243 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCVRNP35243 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RCVRNP35243 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RCVRNP35243 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RCVRNP35243 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RCVRNP35243 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCVRNP35243 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCVRNP35243 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCVRNP35243 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCVRNP35243 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCVRNP35243 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCVRNP35243 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RCVRNP35243 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCVRNP35243 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCVRNP35243 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCVRNP35243 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCVRNP35243 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCVRNP35243 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCVRNP35243 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCVRNP35243 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCVRNP35243 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCVRNP35243 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCVRNP35243 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCVRNP35243 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCVRNP35243 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCVRNP35243 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCVRNP35243 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCVRNP35243 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCVRNP35243 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RCVRNP35243 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RCVRNP35243 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCVRNP35243 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCVRNP35243 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCVRNP35243 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RCVRNP35243 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCVRNP35243 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RCVRNP35243 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RCVRNP35243 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RCVRNP35243 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RCVRNP35243 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCVRNP35243 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCVRNP35243 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCVRNP35243 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCVRNP35243 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCVRNP35243 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCVRNP35243 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCVRNP35243 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCVRNP35243 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCVRNP35243 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RCVRNP35243 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RCVRNP35243 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RCVRNP35243 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCVRNP35243 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCVRNP35243 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCVRNP35243 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCVRNP35243 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCVRNP35243 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCVRNP35243 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RCVRNP35243 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCVRNP35243 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCVRNP35243 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCVRNP35243 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCVRNP35243 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCVRNP35243 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCVRNP35243 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCVRNP35243 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCVRNP35243 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RCVRNP35243 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RCVRNP35243 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RCVRNP35243 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms