Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHRNA3P32297 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHRNA3P32297 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHRNA3P32297 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHRNA3P32297 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHRNA3P32297 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHRNA3P32297 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHRNA3P32297 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHRNA3P32297 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHRNA3P32297 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHRNA3P32297 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHRNA3P32297 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHRNA3P32297 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHRNA3P32297 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHRNA3P32297 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHRNA3P32297 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHRNA3P32297 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHRNA3P32297 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHRNA3P32297 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHRNA3P32297 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHRNA3P32297 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHRNA3P32297 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CHRNA3P32297 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHRNA3P32297 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHRNA3P32297 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CHRNA3P32297 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CHRNA3P32297 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHRNA3P32297 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHRNA3P32297 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHRNA3P32297 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CHRNA3P32297 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHRNA3P32297 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHRNA3P32297 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHRNA3P32297 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHRNA3P32297 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHRNA3P32297 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHRNA3P32297 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHRNA3P32297 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHRNA3P32297 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHRNA3P32297 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHRNA3P32297 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHRNA3P32297 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHRNA3P32297 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHRNA3P32297 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHRNA3P32297 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHRNA3P32297 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHRNA3P32297 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHRNA3P32297 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHRNA3P32297 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHRNA3P32297 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHRNA3P32297 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHRNA3P32297 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHRNA3P32297 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHRNA3P32297 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHRNA3P32297 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHRNA3P32297 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHRNA3P32297 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHRNA3P32297 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHRNA3P32297 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHRNA3P32297 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHRNA3P32297 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHRNA3P32297 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHRNA3P32297 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHRNA3P32297 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHRNA3P32297 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHRNA3P32297 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHRNA3P32297 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHRNA3P32297 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHRNA3P32297 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHRNA3P32297 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHRNA3P32297 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHRNA3P32297 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHRNA3P32297 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHRNA3P32297 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CHRNA3P32297 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHRNA3P32297 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHRNA3P32297 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHRNA3P32297 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHRNA3P32297 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHRNA3P32297 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CHRNA3P32297 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHRNA3P32297 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CHRNA3P32297 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CHRNA3P32297 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CHRNA3P32297 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHRNA3P32297 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CHRNA3P32297 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHRNA3P32297 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CHRNA3P32297 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CHRNA3P32297 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHRNA3P32297 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHRNA3P32297 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CHRNA3P32297 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CHRNA3P32297 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CHRNA3P32297 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CHRNA3P32297 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHRNA3P32297 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CHRNA3P32297 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHRNA3P32297 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CHRNA3P32297 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms