Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CHRNA3P32297 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CHRNA3P32297 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CHRNA3P32297 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CHRNA3P32297 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CHRNA3P32297 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
CHRNA3P32297 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHRNA3P32297 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CHRNA3P32297 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHRNA3P32297 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHRNA3P32297 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CHRNA3P32297 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CHRNA3P32297 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CHRNA3P32297 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHRNA3P32297 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CHRNA3P32297 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
CHRNA3P32297 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CHRNA3P32297 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CHRNA3P32297 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CHRNA3P32297 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CHRNA3P32297 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CHRNA3P32297 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CHRNA3P32297 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CHRNA3P32297 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CHRNA3P32297 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CHRNA3P32297 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
CHRNA3P32297 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CHRNA3P32297 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CHRNA3P32297 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CHRNA3P32297 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CHRNA3P32297 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CHRNA3P32297 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CHRNA3P32297 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CHRNA3P32297 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CHRNA3P32297 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CHRNA3P32297 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CHRNA3P32297 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CHRNA3P32297 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CHRNA3P32297 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CHRNA3P32297 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CHRNA3P32297 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CHRNA3P32297 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CHRNA3P32297 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CHRNA3P32297 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CHRNA3P32297 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CHRNA3P32297 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CHRNA3P32297 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CHRNA3P32297 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CHRNA3P32297 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CHRNA3P32297 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CHRNA3P32297 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CHRNA3P32297 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CHRNA3P32297 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CHRNA3P32297 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CHRNA3P32297 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CHRNA3P32297 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CHRNA3P32297 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CHRNA3P32297 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CHRNA3P32297 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CHRNA3P32297 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CHRNA3P32297 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CHRNA3P32297 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
CHRNA3P32297 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
CHRNA3P32297 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CHRNA3P32297 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHRNA3P32297 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CHRNA3P32297 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHRNA3P32297 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CHRNA3P32297 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CHRNA3P32297 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CHRNA3P32297 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CHRNA3P32297 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
CHRNA3P32297 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CHRNA3P32297 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CHRNA3P32297 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CHRNA3P32297 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CHRNA3P32297 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CHRNA3P32297 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHRNA3P32297 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CHRNA3P32297 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CHRNA3P32297 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CHRNA3P32297 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHRNA3P32297 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CHRNA3P32297 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CHRNA3P32297 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CHRNA3P32297 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
CHRNA3P32297 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CHRNA3P32297 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CHRNA3P32297 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
CHRNA3P32297 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CHRNA3P32297 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CHRNA3P32297 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CHRNA3P32297 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CHRNA3P32297 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CHRNA3P32297 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CHRNA3P32297 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CHRNA3P32297 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CHRNA3P32297 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CHRNA3P32297 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CHRNA3P32297 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms