Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMO1P25800 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMO1P25800 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMO1P25800 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LMO1P25800 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LMO1P25800 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMO1P25800 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMO1P25800 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMO1P25800 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMO1P25800 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMO1P25800 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMO1P25800 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMO1P25800 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMO1P25800 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMO1P25800 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMO1P25800 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMO1P25800 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMO1P25800 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMO1P25800 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LMO1P25800 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMO1P25800 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMO1P25800 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMO1P25800 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LMO1P25800 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LMO1P25800 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO1P25800 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LMO1P25800 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMO1P25800 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMO1P25800 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMO1P25800 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LMO1P25800 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMO1P25800 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LMO1P25800 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMO1P25800 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LMO1P25800 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LMO1P25800 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMO1P25800 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LMO1P25800 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMO1P25800 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LMO1P25800 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LMO1P25800 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMO1P25800 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMO1P25800 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LMO1P25800 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMO1P25800 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMO1P25800 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LMO1P25800 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LMO1P25800 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMO1P25800 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LMO1P25800 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMO1P25800 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMO1P25800 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LMO1P25800 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LMO1P25800 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LMO1P25800 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LMO1P25800 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMO1P25800 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LMO1P25800 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMO1P25800 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMO1P25800 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMO1P25800 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LMO1P25800 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LMO1P25800 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LMO1P25800 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
LMO1P25800 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMO1P25800 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMO1P25800 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMO1P25800 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMO1P25800 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LMO1P25800 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMO1P25800 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMO1P25800 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMO1P25800 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMO1P25800 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMO1P25800 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMO1P25800 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMO1P25800 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMO1P25800 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMO1P25800 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMO1P25800 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMO1P25800 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMO1P25800 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMO1P25800 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMO1P25800 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMO1P25800 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMO1P25800 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMO1P25800 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMO1P25800 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMO1P25800 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMO1P25800 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMO1P25800 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMO1P25800 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMO1P25800 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LMO1P25800 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMO1P25800 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMO1P25800 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMO1P25800 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMO1P25800 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LMO1P25800 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LMO1P25800 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms