Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMO1P25800 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMO1P25800 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LMO1P25800 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMO1P25800 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LMO1P25800 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMO1P25800 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMO1P25800 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMO1P25800 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMO1P25800 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LMO1P25800 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMO1P25800 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMO1P25800 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMO1P25800 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMO1P25800 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LMO1P25800 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMO1P25800 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMO1P25800 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMO1P25800 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMO1P25800 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LMO1P25800 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LMO1P25800 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LMO1P25800 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMO1P25800 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMO1P25800 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMO1P25800 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMO1P25800 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMO1P25800 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMO1P25800 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMO1P25800 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMO1P25800 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMO1P25800 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMO1P25800 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMO1P25800 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LMO1P25800 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LMO1P25800 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMO1P25800 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LMO1P25800 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMO1P25800 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMO1P25800 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMO1P25800 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMO1P25800 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LMO1P25800 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LMO1P25800 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMO1P25800 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMO1P25800 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMO1P25800 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMO1P25800 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMO1P25800 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMO1P25800 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMO1P25800 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LMO1P25800 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMO1P25800 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LMO1P25800 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LMO1P25800 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMO1P25800 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LMO1P25800 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMO1P25800 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMO1P25800 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LMO1P25800 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMO1P25800 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMO1P25800 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMO1P25800 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMO1P25800 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LMO1P25800 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LMO1P25800 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LMO1P25800 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LMO1P25800 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMO1P25800 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMO1P25800 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMO1P25800 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMO1P25800 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMO1P25800 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMO1P25800 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LMO1P25800 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMO1P25800 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMO1P25800 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LMO1P25800 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMO1P25800 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMO1P25800 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMO1P25800 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LMO1P25800 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LMO1P25800 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMO1P25800 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMO1P25800 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMO1P25800 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LMO1P25800 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO1P25800 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMO1P25800 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMO1P25800 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LMO1P25800 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMO1P25800 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMO1P25800 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMO1P25800 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMO1P25800 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMO1P25800 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO1P25800 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMO1P25800 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMO1P25800 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMO1P25800 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms