Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAMP1P23763 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VAMP1P23763 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAMP1P23763 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VAMP1P23763 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VAMP1P23763 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VAMP1P23763 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VAMP1P23763 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAMP1P23763 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VAMP1P23763 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VAMP1P23763 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAMP1P23763 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VAMP1P23763 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAMP1P23763 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VAMP1P23763 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VAMP1P23763 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAMP1P23763 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VAMP1P23763 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAMP1P23763 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAMP1P23763 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VAMP1P23763 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAMP1P23763 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAMP1P23763 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VAMP1P23763 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VAMP1P23763 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAMP1P23763 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAMP1P23763 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAMP1P23763 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VAMP1P23763 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VAMP1P23763 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAMP1P23763 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAMP1P23763 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAMP1P23763 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAMP1P23763 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAMP1P23763 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAMP1P23763 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAMP1P23763 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAMP1P23763 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAMP1P23763 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAMP1P23763 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAMP1P23763 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VAMP1P23763 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAMP1P23763 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAMP1P23763 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAMP1P23763 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAMP1P23763 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAMP1P23763 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAMP1P23763 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAMP1P23763 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAMP1P23763 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VAMP1P23763 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VAMP1P23763 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAMP1P23763 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAMP1P23763 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAMP1P23763 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAMP1P23763 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAMP1P23763 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAMP1P23763 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAMP1P23763 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAMP1P23763 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAMP1P23763 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAMP1P23763 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAMP1P23763 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAMP1P23763 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAMP1P23763 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAMP1P23763 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAMP1P23763 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAMP1P23763 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAMP1P23763 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAMP1P23763 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VAMP1P23763 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VAMP1P23763 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAMP1P23763 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VAMP1P23763 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VAMP1P23763 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAMP1P23763 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAMP1P23763 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAMP1P23763 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VAMP1P23763 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
VAMP1P23763 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAMP1P23763 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VAMP1P23763 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VAMP1P23763 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAMP1P23763 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAMP1P23763 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VAMP1P23763 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VAMP1P23763 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAMP1P23763 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VAMP1P23763 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VAMP1P23763 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAMP1P23763 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAMP1P23763 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAMP1P23763 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAMP1P23763 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAMP1P23763 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAMP1P23763 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAMP1P23763 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAMP1P23763 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAMP1P23763 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAMP1P23763 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms