Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ME2P23368 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ME2P23368 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ME2P23368 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ME2P23368 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ME2P23368 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ME2P23368 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ME2P23368 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ME2P23368 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ME2P23368 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ME2P23368 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ME2P23368 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ME2P23368 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ME2P23368 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ME2P23368 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ME2P23368 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ME2P23368 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ME2P23368 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ME2P23368 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ME2P23368 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ME2P23368 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ME2P23368 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ME2P23368 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ME2P23368 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ME2P23368 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ME2P23368 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ME2P23368 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ME2P23368 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ME2P23368 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ME2P23368 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ME2P23368 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ME2P23368 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ME2P23368 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ME2P23368 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ME2P23368 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ME2P23368 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ME2P23368 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ME2P23368 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ME2P23368 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ME2P23368 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ME2P23368 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ME2P23368 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ME2P23368 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ME2P23368 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ME2P23368 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ME2P23368 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ME2P23368 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ME2P23368 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ME2P23368 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ME2P23368 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ME2P23368 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ME2P23368 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ME2P23368 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ME2P23368 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ME2P23368 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ME2P23368 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ME2P23368 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ME2P23368 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ME2P23368 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ME2P23368 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
ME2P23368 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ME2P23368 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ME2P23368 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ME2P23368 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ME2P23368 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ME2P23368 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ME2P23368 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ME2P23368 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ME2P23368 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ME2P23368 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ME2P23368 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ME2P23368 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ME2P23368 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ME2P23368 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ME2P23368 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ME2P23368 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ME2P23368 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ME2P23368 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ME2P23368 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ME2P23368 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ME2P23368 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ME2P23368 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ME2P23368 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ME2P23368 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ME2P23368 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ME2P23368 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ME2P23368 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ME2P23368 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ME2P23368 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ME2P23368 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ME2P23368 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ME2P23368 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ME2P23368 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ME2P23368 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ME2P23368 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ME2P23368 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ME2P23368 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ME2P23368 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ME2P23368 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ME2P23368 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms