Protein–RNA interactions for Protein: P20382

PMCH, Pro-MCH, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHP20382 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMCHP20382 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMCHP20382 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMCHP20382 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMCHP20382 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMCHP20382 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PMCHP20382 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PMCHP20382 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMCHP20382 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
PMCHP20382 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMCHP20382 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMCHP20382 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMCHP20382 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMCHP20382 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMCHP20382 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMCHP20382 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMCHP20382 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PMCHP20382 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PMCHP20382 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMCHP20382 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMCHP20382 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PMCHP20382 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PMCHP20382 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PMCHP20382 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PMCHP20382 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PMCHP20382 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PMCHP20382 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PMCHP20382 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PMCHP20382 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PMCHP20382 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PMCHP20382 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PMCHP20382 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PMCHP20382 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PMCHP20382 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PMCHP20382 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PMCHP20382 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PMCHP20382 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PMCHP20382 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PMCHP20382 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PMCHP20382 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PMCHP20382 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PMCHP20382 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PMCHP20382 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PMCHP20382 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PMCHP20382 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PMCHP20382 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PMCHP20382 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PMCHP20382 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PMCHP20382 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PMCHP20382 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PMCHP20382 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PMCHP20382 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PMCHP20382 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PMCHP20382 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
PMCHP20382 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PMCHP20382 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMCHP20382 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMCHP20382 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMCHP20382 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMCHP20382 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PMCHP20382 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PMCHP20382 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PMCHP20382 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PMCHP20382 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PMCHP20382 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PMCHP20382 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PMCHP20382 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PMCHP20382 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PMCHP20382 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PMCHP20382 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PMCHP20382 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PMCHP20382 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PMCHP20382 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PMCHP20382 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PMCHP20382 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PMCHP20382 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PMCHP20382 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PMCHP20382 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PMCHP20382 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PMCHP20382 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PMCHP20382 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PMCHP20382 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PMCHP20382 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PMCHP20382 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PMCHP20382 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PMCHP20382 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PMCHP20382 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PMCHP20382 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PMCHP20382 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PMCHP20382 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PMCHP20382 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PMCHP20382 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PMCHP20382 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PMCHP20382 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PMCHP20382 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PMCHP20382 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PMCHP20382 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PMCHP20382 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PMCHP20382 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PMCHP20382 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms