Protein–RNA interactions for Protein: P19484

TFEB, Transcription factor EB, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFEBP19484 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TFEBP19484 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TFEBP19484 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TFEBP19484 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TFEBP19484 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TFEBP19484 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TFEBP19484 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TFEBP19484 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TFEBP19484 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TFEBP19484 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TFEBP19484 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TFEBP19484 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TFEBP19484 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TFEBP19484 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TFEBP19484 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TFEBP19484 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TFEBP19484 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TFEBP19484 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TFEBP19484 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TFEBP19484 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TFEBP19484 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TFEBP19484 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TFEBP19484 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TFEBP19484 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TFEBP19484 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TFEBP19484 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TFEBP19484 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TFEBP19484 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TFEBP19484 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TFEBP19484 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TFEBP19484 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TFEBP19484 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TFEBP19484 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TFEBP19484 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TFEBP19484 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TFEBP19484 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TFEBP19484 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TFEBP19484 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TFEBP19484 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TFEBP19484 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TFEBP19484 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TFEBP19484 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TFEBP19484 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TFEBP19484 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TFEBP19484 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TFEBP19484 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TFEBP19484 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TFEBP19484 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TFEBP19484 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TFEBP19484 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
TFEBP19484 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TFEBP19484 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TFEBP19484 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TFEBP19484 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TFEBP19484 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TFEBP19484 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TFEBP19484 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TFEBP19484 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TFEBP19484 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TFEBP19484 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TFEBP19484 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TFEBP19484 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TFEBP19484 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TFEBP19484 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TFEBP19484 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TFEBP19484 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TFEBP19484 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TFEBP19484 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TFEBP19484 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TFEBP19484 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TFEBP19484 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TFEBP19484 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TFEBP19484 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TFEBP19484 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TFEBP19484 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TFEBP19484 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TFEBP19484 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TFEBP19484 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TFEBP19484 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TFEBP19484 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TFEBP19484 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TFEBP19484 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TFEBP19484 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TFEBP19484 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TFEBP19484 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TFEBP19484 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TFEBP19484 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TFEBP19484 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TFEBP19484 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TFEBP19484 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TFEBP19484 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TFEBP19484 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TFEBP19484 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TFEBP19484 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TFEBP19484 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TFEBP19484 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TFEBP19484 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TFEBP19484 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TFEBP19484 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TFEBP19484 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms