Protein–RNA interactions for Protein: P19022

CDH2, Cadherin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH2P19022 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDH2P19022 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDH2P19022 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDH2P19022 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDH2P19022 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH2P19022 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH2P19022 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDH2P19022 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDH2P19022 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDH2P19022 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDH2P19022 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDH2P19022 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDH2P19022 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDH2P19022 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDH2P19022 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDH2P19022 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDH2P19022 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CDH2P19022 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDH2P19022 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDH2P19022 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDH2P19022 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CDH2P19022 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDH2P19022 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH2P19022 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CDH2P19022 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDH2P19022 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDH2P19022 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH2P19022 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH2P19022 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDH2P19022 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDH2P19022 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDH2P19022 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH2P19022 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH2P19022 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH2P19022 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH2P19022 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH2P19022 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH2P19022 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CDH2P19022 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDH2P19022 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDH2P19022 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH2P19022 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH2P19022 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDH2P19022 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDH2P19022 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CDH2P19022 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDH2P19022 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDH2P19022 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH2P19022 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDH2P19022 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CDH2P19022 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDH2P19022 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH2P19022 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDH2P19022 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH2P19022 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDH2P19022 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDH2P19022 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDH2P19022 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH2P19022 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDH2P19022 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDH2P19022 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDH2P19022 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDH2P19022 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDH2P19022 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH2P19022 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDH2P19022 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDH2P19022 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDH2P19022 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH2P19022 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH2P19022 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDH2P19022 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDH2P19022 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDH2P19022 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDH2P19022 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDH2P19022 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDH2P19022 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDH2P19022 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDH2P19022 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDH2P19022 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDH2P19022 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDH2P19022 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDH2P19022 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDH2P19022 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDH2P19022 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDH2P19022 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH2P19022 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH2P19022 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDH2P19022 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDH2P19022 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDH2P19022 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDH2P19022 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDH2P19022 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDH2P19022 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDH2P19022 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDH2P19022 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDH2P19022 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDH2P19022 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH2P19022 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH2P19022 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH2P19022 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms