Protein–RNA interactions for Protein: P18887

XRCC1, DNA repair protein XRCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC1P18887 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
XRCC1P18887 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
XRCC1P18887 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
XRCC1P18887 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
XRCC1P18887 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
XRCC1P18887 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
XRCC1P18887 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
XRCC1P18887 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
XRCC1P18887 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
XRCC1P18887 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
XRCC1P18887 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
XRCC1P18887 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
XRCC1P18887 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
XRCC1P18887 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
XRCC1P18887 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
XRCC1P18887 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
XRCC1P18887 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
XRCC1P18887 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
XRCC1P18887 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
XRCC1P18887 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
XRCC1P18887 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
XRCC1P18887 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
XRCC1P18887 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
XRCC1P18887 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
XRCC1P18887 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
XRCC1P18887 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XRCC1P18887 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
XRCC1P18887 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
XRCC1P18887 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
XRCC1P18887 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
XRCC1P18887 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
XRCC1P18887 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
XRCC1P18887 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
XRCC1P18887 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
XRCC1P18887 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
XRCC1P18887 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
XRCC1P18887 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
XRCC1P18887 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
XRCC1P18887 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
XRCC1P18887 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
XRCC1P18887 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
XRCC1P18887 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
XRCC1P18887 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
XRCC1P18887 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
XRCC1P18887 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
XRCC1P18887 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
XRCC1P18887 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
XRCC1P18887 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
XRCC1P18887 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
XRCC1P18887 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
XRCC1P18887 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
XRCC1P18887 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
XRCC1P18887 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
XRCC1P18887 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
XRCC1P18887 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
XRCC1P18887 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
XRCC1P18887 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
XRCC1P18887 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
XRCC1P18887 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
XRCC1P18887 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
XRCC1P18887 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
XRCC1P18887 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
XRCC1P18887 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
XRCC1P18887 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
XRCC1P18887 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
XRCC1P18887 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
XRCC1P18887 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
XRCC1P18887 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
XRCC1P18887 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
XRCC1P18887 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
XRCC1P18887 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
XRCC1P18887 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
XRCC1P18887 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
XRCC1P18887 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
XRCC1P18887 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
XRCC1P18887 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
XRCC1P18887 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
XRCC1P18887 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
XRCC1P18887 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
XRCC1P18887 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
XRCC1P18887 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
XRCC1P18887 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
XRCC1P18887 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
XRCC1P18887 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
XRCC1P18887 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
XRCC1P18887 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
XRCC1P18887 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
XRCC1P18887 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
XRCC1P18887 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
XRCC1P18887 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XRCC1P18887 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XRCC1P18887 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XRCC1P18887 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
XRCC1P18887 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
XRCC1P18887 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
XRCC1P18887 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
XRCC1P18887 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
XRCC1P18887 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
XRCC1P18887 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
XRCC1P18887 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms