Protein–RNA interactions for Protein: P15172

MYOD1, Myoblast determination protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOD1P15172 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYOD1P15172 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYOD1P15172 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYOD1P15172 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYOD1P15172 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYOD1P15172 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYOD1P15172 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYOD1P15172 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYOD1P15172 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYOD1P15172 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MYOD1P15172 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYOD1P15172 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYOD1P15172 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MYOD1P15172 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYOD1P15172 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYOD1P15172 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYOD1P15172 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MYOD1P15172 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYOD1P15172 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYOD1P15172 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MYOD1P15172 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MYOD1P15172 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYOD1P15172 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MYOD1P15172 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYOD1P15172 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYOD1P15172 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MYOD1P15172 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MYOD1P15172 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYOD1P15172 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYOD1P15172 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MYOD1P15172 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYOD1P15172 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MYOD1P15172 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYOD1P15172 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYOD1P15172 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYOD1P15172 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYOD1P15172 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MYOD1P15172 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYOD1P15172 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYOD1P15172 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYOD1P15172 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYOD1P15172 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYOD1P15172 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYOD1P15172 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYOD1P15172 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MYOD1P15172 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYOD1P15172 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYOD1P15172 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYOD1P15172 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYOD1P15172 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYOD1P15172 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYOD1P15172 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MYOD1P15172 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYOD1P15172 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MYOD1P15172 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MYOD1P15172 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYOD1P15172 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MYOD1P15172 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYOD1P15172 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYOD1P15172 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MYOD1P15172 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYOD1P15172 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MYOD1P15172 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYOD1P15172 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYOD1P15172 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYOD1P15172 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYOD1P15172 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MYOD1P15172 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MYOD1P15172 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MYOD1P15172 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYOD1P15172 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYOD1P15172 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MYOD1P15172 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MYOD1P15172 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MYOD1P15172 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MYOD1P15172 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MYOD1P15172 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MYOD1P15172 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MYOD1P15172 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MYOD1P15172 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYOD1P15172 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYOD1P15172 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MYOD1P15172 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MYOD1P15172 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MYOD1P15172 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYOD1P15172 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MYOD1P15172 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYOD1P15172 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MYOD1P15172 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MYOD1P15172 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MYOD1P15172 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MYOD1P15172 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MYOD1P15172 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYOD1P15172 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MYOD1P15172 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYOD1P15172 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MYOD1P15172 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MYOD1P15172 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYOD1P15172 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MYOD1P15172 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms