Protein–RNA interactions for Protein: P0DP72

VSIG10L2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10L2P0DP72 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VSIG10L2P0DP72 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VSIG10L2P0DP72 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VSIG10L2P0DP72 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VSIG10L2P0DP72 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VSIG10L2P0DP72 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
VSIG10L2P0DP72 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
VSIG10L2P0DP72 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
VSIG10L2P0DP72 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
VSIG10L2P0DP72 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VSIG10L2P0DP72 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
VSIG10L2P0DP72 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VSIG10L2P0DP72 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VSIG10L2P0DP72 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VSIG10L2P0DP72 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSIG10L2P0DP72 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VSIG10L2P0DP72 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VSIG10L2P0DP72 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSIG10L2P0DP72 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VSIG10L2P0DP72 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSIG10L2P0DP72 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VSIG10L2P0DP72 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
VSIG10L2P0DP72 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VSIG10L2P0DP72 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSIG10L2P0DP72 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSIG10L2P0DP72 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VSIG10L2P0DP72 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSIG10L2P0DP72 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VSIG10L2P0DP72 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VSIG10L2P0DP72 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSIG10L2P0DP72 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VSIG10L2P0DP72 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSIG10L2P0DP72 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSIG10L2P0DP72 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VSIG10L2P0DP72 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSIG10L2P0DP72 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VSIG10L2P0DP72 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSIG10L2P0DP72 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSIG10L2P0DP72 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VSIG10L2P0DP72 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VSIG10L2P0DP72 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VSIG10L2P0DP72 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VSIG10L2P0DP72 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VSIG10L2P0DP72 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VSIG10L2P0DP72 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSIG10L2P0DP72 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VSIG10L2P0DP72 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSIG10L2P0DP72 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VSIG10L2P0DP72 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VSIG10L2P0DP72 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VSIG10L2P0DP72 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VSIG10L2P0DP72 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSIG10L2P0DP72 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSIG10L2P0DP72 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VSIG10L2P0DP72 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VSIG10L2P0DP72 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
VSIG10L2P0DP72 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VSIG10L2P0DP72 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VSIG10L2P0DP72 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VSIG10L2P0DP72 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSIG10L2P0DP72 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VSIG10L2P0DP72 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSIG10L2P0DP72 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSIG10L2P0DP72 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSIG10L2P0DP72 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VSIG10L2P0DP72 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VSIG10L2P0DP72 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VSIG10L2P0DP72 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VSIG10L2P0DP72 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VSIG10L2P0DP72 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VSIG10L2P0DP72 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VSIG10L2P0DP72 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VSIG10L2P0DP72 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VSIG10L2P0DP72 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VSIG10L2P0DP72 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VSIG10L2P0DP72 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VSIG10L2P0DP72 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VSIG10L2P0DP72 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSIG10L2P0DP72 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VSIG10L2P0DP72 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VSIG10L2P0DP72 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VSIG10L2P0DP72 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VSIG10L2P0DP72 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VSIG10L2P0DP72 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VSIG10L2P0DP72 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSIG10L2P0DP72 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSIG10L2P0DP72 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSIG10L2P0DP72 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VSIG10L2P0DP72 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VSIG10L2P0DP72 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VSIG10L2P0DP72 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VSIG10L2P0DP72 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSIG10L2P0DP72 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSIG10L2P0DP72 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSIG10L2P0DP72 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSIG10L2P0DP72 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VSIG10L2P0DP72 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VSIG10L2P0DP72 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VSIG10L2P0DP72 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VSIG10L2P0DP72 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms