Protein–RNA interactions for Protein: P0DP01

IGHV1-8, Immunoglobulin heavy variable 1-8, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-8P0DP01 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGHV1-8P0DP01 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGHV1-8P0DP01 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGHV1-8P0DP01 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHV1-8P0DP01 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHV1-8P0DP01 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGHV1-8P0DP01 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV1-8P0DP01 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV1-8P0DP01 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGHV1-8P0DP01 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGHV1-8P0DP01 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHV1-8P0DP01 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGHV1-8P0DP01 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV1-8P0DP01 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV1-8P0DP01 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV1-8P0DP01 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGHV1-8P0DP01 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHV1-8P0DP01 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHV1-8P0DP01 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGHV1-8P0DP01 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHV1-8P0DP01 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGHV1-8P0DP01 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHV1-8P0DP01 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGHV1-8P0DP01 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGHV1-8P0DP01 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGHV1-8P0DP01 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGHV1-8P0DP01 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHV1-8P0DP01 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGHV1-8P0DP01 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGHV1-8P0DP01 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGHV1-8P0DP01 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGHV1-8P0DP01 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGHV1-8P0DP01 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGHV1-8P0DP01 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IGHV1-8P0DP01 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGHV1-8P0DP01 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IGHV1-8P0DP01 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IGHV1-8P0DP01 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHV1-8P0DP01 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHV1-8P0DP01 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHV1-8P0DP01 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGHV1-8P0DP01 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGHV1-8P0DP01 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHV1-8P0DP01 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGHV1-8P0DP01 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGHV1-8P0DP01 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IGHV1-8P0DP01 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHV1-8P0DP01 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHV1-8P0DP01 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGHV1-8P0DP01 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHV1-8P0DP01 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHV1-8P0DP01 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHV1-8P0DP01 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHV1-8P0DP01 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHV1-8P0DP01 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHV1-8P0DP01 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHV1-8P0DP01 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHV1-8P0DP01 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHV1-8P0DP01 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHV1-8P0DP01 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHV1-8P0DP01 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGHV1-8P0DP01 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IGHV1-8P0DP01 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IGHV1-8P0DP01 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGHV1-8P0DP01 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGHV1-8P0DP01 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGHV1-8P0DP01 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGHV1-8P0DP01 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGHV1-8P0DP01 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGHV1-8P0DP01 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGHV1-8P0DP01 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGHV1-8P0DP01 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHV1-8P0DP01 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHV1-8P0DP01 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHV1-8P0DP01 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHV1-8P0DP01 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGHV1-8P0DP01 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGHV1-8P0DP01 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGHV1-8P0DP01 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV1-8P0DP01 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV1-8P0DP01 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHV1-8P0DP01 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHV1-8P0DP01 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHV1-8P0DP01 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV1-8P0DP01 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV1-8P0DP01 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV1-8P0DP01 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV1-8P0DP01 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHV1-8P0DP01 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHV1-8P0DP01 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHV1-8P0DP01 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHV1-8P0DP01 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHV1-8P0DP01 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHV1-8P0DP01 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHV1-8P0DP01 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHV1-8P0DP01 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHV1-8P0DP01 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV1-8P0DP01 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGHV1-8P0DP01 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGHV1-8P0DP01 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms