Protein–RNA interactions for Protein: P0C091

FREM3, FRAS1-related extracellular matrix protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM3P0C091 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FREM3P0C091 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FREM3P0C091 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FREM3P0C091 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FREM3P0C091 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FREM3P0C091 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FREM3P0C091 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FREM3P0C091 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FREM3P0C091 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FREM3P0C091 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FREM3P0C091 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FREM3P0C091 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FREM3P0C091 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FREM3P0C091 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FREM3P0C091 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FREM3P0C091 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FREM3P0C091 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FREM3P0C091 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FREM3P0C091 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FREM3P0C091 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FREM3P0C091 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FREM3P0C091 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FREM3P0C091 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
FREM3P0C091 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FREM3P0C091 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FREM3P0C091 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FREM3P0C091 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FREM3P0C091 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FREM3P0C091 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FREM3P0C091 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FREM3P0C091 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FREM3P0C091 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FREM3P0C091 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FREM3P0C091 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FREM3P0C091 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FREM3P0C091 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FREM3P0C091 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FREM3P0C091 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FREM3P0C091 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FREM3P0C091 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FREM3P0C091 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FREM3P0C091 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FREM3P0C091 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FREM3P0C091 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FREM3P0C091 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FREM3P0C091 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
FREM3P0C091 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FREM3P0C091 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FREM3P0C091 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FREM3P0C091 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FREM3P0C091 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FREM3P0C091 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FREM3P0C091 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FREM3P0C091 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FREM3P0C091 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FREM3P0C091 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FREM3P0C091 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FREM3P0C091 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FREM3P0C091 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FREM3P0C091 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FREM3P0C091 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FREM3P0C091 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FREM3P0C091 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FREM3P0C091 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FREM3P0C091 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FREM3P0C091 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FREM3P0C091 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FREM3P0C091 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FREM3P0C091 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FREM3P0C091 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FREM3P0C091 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FREM3P0C091 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FREM3P0C091 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FREM3P0C091 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FREM3P0C091 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FREM3P0C091 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FREM3P0C091 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FREM3P0C091 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FREM3P0C091 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FREM3P0C091 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FREM3P0C091 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FREM3P0C091 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FREM3P0C091 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FREM3P0C091 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FREM3P0C091 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FREM3P0C091 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FREM3P0C091 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FREM3P0C091 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FREM3P0C091 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FREM3P0C091 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FREM3P0C091 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FREM3P0C091 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FREM3P0C091 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FREM3P0C091 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FREM3P0C091 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FREM3P0C091 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FREM3P0C091 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FREM3P0C091 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FREM3P0C091 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FREM3P0C091 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms