Protein–RNA interactions for Protein: P09919

CSF3, Granulocyte colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3P09919 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CSF3P09919 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSF3P09919 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CSF3P09919 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSF3P09919 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CSF3P09919 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CSF3P09919 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CSF3P09919 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSF3P09919 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CSF3P09919 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSF3P09919 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSF3P09919 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSF3P09919 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSF3P09919 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSF3P09919 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSF3P09919 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSF3P09919 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CSF3P09919 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSF3P09919 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CSF3P09919 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSF3P09919 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CSF3P09919 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CSF3P09919 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSF3P09919 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CSF3P09919 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSF3P09919 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CSF3P09919 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSF3P09919 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CSF3P09919 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CSF3P09919 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSF3P09919 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSF3P09919 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CSF3P09919 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSF3P09919 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CSF3P09919 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CSF3P09919 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CSF3P09919 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSF3P09919 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CSF3P09919 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CSF3P09919 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CSF3P09919 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CSF3P09919 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF3P09919 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF3P09919 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CSF3P09919 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSF3P09919 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSF3P09919 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CSF3P09919 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSF3P09919 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSF3P09919 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSF3P09919 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSF3P09919 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSF3P09919 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSF3P09919 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF3P09919 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF3P09919 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF3P09919 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF3P09919 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSF3P09919 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF3P09919 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF3P09919 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF3P09919 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSF3P09919 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF3P09919 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF3P09919 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF3P09919 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSF3P09919 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSF3P09919 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSF3P09919 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSF3P09919 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSF3P09919 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSF3P09919 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSF3P09919 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF3P09919 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSF3P09919 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSF3P09919 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSF3P09919 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSF3P09919 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSF3P09919 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSF3P09919 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF3P09919 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF3P09919 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSF3P09919 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSF3P09919 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSF3P09919 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSF3P09919 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSF3P09919 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSF3P09919 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF3P09919 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF3P09919 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSF3P09919 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSF3P09919 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSF3P09919 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSF3P09919 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSF3P09919 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSF3P09919 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSF3P09919 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CSF3P09919 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSF3P09919 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSF3P09919 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms