Protein–RNA interactions for Protein: P08779

KRT16, Keratin, type I cytoskeletal 16, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT16P08779 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT16P08779 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT16P08779 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT16P08779 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT16P08779 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT16P08779 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT16P08779 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT16P08779 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT16P08779 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT16P08779 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KRT16P08779 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT16P08779 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KRT16P08779 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT16P08779 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT16P08779 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KRT16P08779 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT16P08779 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KRT16P08779 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT16P08779 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT16P08779 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT16P08779 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT16P08779 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KRT16P08779 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KRT16P08779 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KRT16P08779 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT16P08779 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT16P08779 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT16P08779 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT16P08779 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT16P08779 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT16P08779 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT16P08779 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT16P08779 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT16P08779 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT16P08779 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT16P08779 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT16P08779 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KRT16P08779 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT16P08779 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT16P08779 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT16P08779 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT16P08779 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT16P08779 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT16P08779 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT16P08779 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT16P08779 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT16P08779 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT16P08779 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT16P08779 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT16P08779 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT16P08779 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT16P08779 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT16P08779 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT16P08779 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT16P08779 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT16P08779 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT16P08779 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT16P08779 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT16P08779 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT16P08779 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT16P08779 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT16P08779 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT16P08779 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT16P08779 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT16P08779 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT16P08779 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT16P08779 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT16P08779 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT16P08779 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT16P08779 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT16P08779 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT16P08779 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT16P08779 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT16P08779 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT16P08779 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KRT16P08779 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KRT16P08779 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT16P08779 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT16P08779 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT16P08779 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KRT16P08779 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KRT16P08779 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KRT16P08779 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KRT16P08779 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT16P08779 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT16P08779 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT16P08779 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KRT16P08779 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KRT16P08779 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
KRT16P08779 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT16P08779 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KRT16P08779 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KRT16P08779 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT16P08779 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KRT16P08779 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KRT16P08779 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KRT16P08779 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT16P08779 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KRT16P08779 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KRT16P08779 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms