Protein–RNA interactions for Protein: P04629

NTRK1, High affinity nerve growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK1P04629 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NTRK1P04629 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NTRK1P04629 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NTRK1P04629 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NTRK1P04629 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NTRK1P04629 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NTRK1P04629 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NTRK1P04629 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NTRK1P04629 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NTRK1P04629 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NTRK1P04629 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NTRK1P04629 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NTRK1P04629 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NTRK1P04629 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NTRK1P04629 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NTRK1P04629 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NTRK1P04629 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NTRK1P04629 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NTRK1P04629 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NTRK1P04629 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NTRK1P04629 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NTRK1P04629 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NTRK1P04629 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NTRK1P04629 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NTRK1P04629 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NTRK1P04629 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NTRK1P04629 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NTRK1P04629 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NTRK1P04629 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NTRK1P04629 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NTRK1P04629 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NTRK1P04629 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NTRK1P04629 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NTRK1P04629 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NTRK1P04629 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NTRK1P04629 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NTRK1P04629 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NTRK1P04629 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NTRK1P04629 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NTRK1P04629 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NTRK1P04629 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NTRK1P04629 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NTRK1P04629 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NTRK1P04629 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NTRK1P04629 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NTRK1P04629 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NTRK1P04629 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NTRK1P04629 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NTRK1P04629 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NTRK1P04629 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NTRK1P04629 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NTRK1P04629 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NTRK1P04629 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NTRK1P04629 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NTRK1P04629 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NTRK1P04629 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
NTRK1P04629 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NTRK1P04629 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NTRK1P04629 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NTRK1P04629 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NTRK1P04629 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NTRK1P04629 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NTRK1P04629 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NTRK1P04629 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NTRK1P04629 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NTRK1P04629 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NTRK1P04629 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NTRK1P04629 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NTRK1P04629 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NTRK1P04629 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NTRK1P04629 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NTRK1P04629 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NTRK1P04629 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NTRK1P04629 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NTRK1P04629 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NTRK1P04629 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NTRK1P04629 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NTRK1P04629 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NTRK1P04629 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NTRK1P04629 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NTRK1P04629 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NTRK1P04629 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NTRK1P04629 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NTRK1P04629 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NTRK1P04629 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NTRK1P04629 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NTRK1P04629 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NTRK1P04629 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NTRK1P04629 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NTRK1P04629 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NTRK1P04629 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NTRK1P04629 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NTRK1P04629 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NTRK1P04629 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NTRK1P04629 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NTRK1P04629 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NTRK1P04629 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NTRK1P04629 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NTRK1P04629 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NTRK1P04629 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms