Protein–RNA interactions for Protein: O95716

RAB3D, Ras-related protein Rab-3D, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3DO95716 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB3DO95716 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB3DO95716 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB3DO95716 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3DO95716 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3DO95716 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB3DO95716 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB3DO95716 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB3DO95716 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB3DO95716 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB3DO95716 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB3DO95716 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB3DO95716 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB3DO95716 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB3DO95716 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB3DO95716 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB3DO95716 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB3DO95716 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3DO95716 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB3DO95716 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB3DO95716 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB3DO95716 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB3DO95716 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB3DO95716 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3DO95716 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3DO95716 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3DO95716 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB3DO95716 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3DO95716 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3DO95716 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB3DO95716 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB3DO95716 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB3DO95716 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB3DO95716 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB3DO95716 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB3DO95716 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB3DO95716 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB3DO95716 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB3DO95716 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB3DO95716 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB3DO95716 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3DO95716 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3DO95716 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB3DO95716 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB3DO95716 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB3DO95716 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB3DO95716 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3DO95716 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB3DO95716 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB3DO95716 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB3DO95716 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB3DO95716 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB3DO95716 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB3DO95716 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB3DO95716 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3DO95716 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3DO95716 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB3DO95716 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB3DO95716 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB3DO95716 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3DO95716 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3DO95716 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3DO95716 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3DO95716 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3DO95716 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3DO95716 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB3DO95716 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3DO95716 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3DO95716 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB3DO95716 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3DO95716 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB3DO95716 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3DO95716 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3DO95716 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB3DO95716 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3DO95716 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3DO95716 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB3DO95716 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB3DO95716 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB3DO95716 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB3DO95716 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3DO95716 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3DO95716 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB3DO95716 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3DO95716 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3DO95716 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3DO95716 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB3DO95716 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3DO95716 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB3DO95716 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB3DO95716 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB3DO95716 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB3DO95716 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB3DO95716 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB3DO95716 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3DO95716 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB3DO95716 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB3DO95716 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3DO95716 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB3DO95716 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms